Lipides
Gouttelettes lipidiques
(Lipid droplets ou LD)
Sites de contact membranaires (MCS)
MCS avec les mitochondries et les peroxysomes
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Les gouttelettes lipidiques sont en contact avec les mitochondries et les peroxysomes pour transférer les acides gras (FA) en vue de plusieurs processus métaboliques dont la β-oxydation.
Les gouttelettes lipidiques (LD) sont en contact avec différents organites impliqués dans le métabolisme lipidique (Applying systems-level spectral imaging and analysis to reveal the organelle interactome 2017) :
- le réticulum endoplasmique (RE),
- les mitochondries,
- les peroxisomes,
- les endosomes/lysosomes,
- l'appareil de Golgi,
- le noyau,
- les autres LD.
Remarque : de nombreux MCS sont tripartites, i.e. entre plusieurs organites, comme par exemple les MCS mitochondries-RE-LD pour le stockage des triglycérides (TG).
MCS LD-mitochondries
Le chapitre est complexe et vous pouvez lire : Touch and Go: Membrane Contact Sites Between Lipid Droplets and Other Organelles (2022).
1. Plusieurs protéines sont impliquées dans les MCS LD-mitochondries (Mitochondria Bound to Lipid Droplets: Where mitochondrial dynamics regulate lipid storage and utilization 2019).
- MIGA2 (MitoGuArdine 2) est le seul lien direct LD-mitochondries.
- Les autres forment des complexes dont certains partenaires n'ont pas encore été identifiés.
2. Ces MCS pourraient canaliser les acides gras (FA) libérés par les triglycérides (TG) stockés dans la LD directement dans les mitochondries, où ils peuvent être utilisés pour la β-oxydation (Perspectives on Mitochondria–ER and Mitochondria–Lipid Droplet Contact in Hepatocytes and Hepatic Lipid Metabolism 2021).
L’activation de la réponse protéique déployée et le stress du RE peuvent stimuler la biogenèse des LD comme moyen de stocker les lipides tandis que les voies de synthèse des lipides dans le RE sont suspendues.
Ces MCS font partie d'un ensemble plus vaste appelé MCS tripartite : RE-LD-mitochondries.
Transfert des lipides
Les protéines de transport des lipides au niveau des contacts membranaires, où les organites sont étroitement liées, sont essentielles à la redistribution des lipides du réticulum endoplasmique (RE), où ils sont fabriqués, vers d'autres membranes cellulaires.
Un tel transfert médié par les protéines est particulièrement important pour maintenir les organites déconnectés des voies de sécrétion, comme les mitochondries.
Contact direct : MIGA2
MIGA2 (MitoGuArdine 2) est une protéine de la membrane externe des mitochondries (OMM) qui (Mitoguardin Regulates Mitochondrial Fusion through MitoPLD and Is Required for Neuronal Homeostasis 2016) :
- favorise la fusion mitochondriale ( MIGA1/2 et fusion mitochondriale),
- régule métabolisme des phospholipides (PL) mitochondriaux.
Toutefois, la mitoguardine-2, se trouve aussi au contact direct du RE et/ou des gouttelettes lipidiques.
1. MIGA2 est formé de plusieurs domaines.
- Les domaines transmembranaires N-terminaux se lient aux mitochondries.
- La région centrale, i.e. coiled-coil (superhélice), permettrait peut-être sa dimérisation.
- La région amphipathique C-terminale est exposée au cytosol et se lie directement aux LD.
2. MIGA2 pourrait être aussi un transporteur de lipides (Mitoguardin-2–mediated lipid transfer preserves mitochondrial morphology and lipid droplet formation 2022).
- Le domaine C-terminal de la mitoguardine-2 possède une cavité hydrophobe qui lie les lipides.
- Chaque mitoguardine-2 peut accueillir jusqu'à deux lipides, i.e. glycérophospholipides et acides gras (FA) libres.
3. MIGA2 lie la mitochondrie :
- directement la LD (MIGA2 Links Mitochondria, the ER, and Lipid Droplets and Promotes De Novo Lipogenesis in Adipocytes 2019).
- indirectement le RE par les protéines VAP (VAMP-Associated Protein).
4. La manipulation de MIGA2 provoquent les conséquences suivantes.
- La surexpression de MIGA2 dans les adipocytes entraîne une formation accrue de MCS LD-mitochondries.
- Les adipocytes MIGA2-KO montrent une diminution de la différenciation adipocytaire et de la synthèse des triglycérides (TG) et la présence d'un grand nombre de petites LD.
Contacts indirects
Lors de jeûne, les acides gras (FA libérés par les gouttelettes lipidiques par lipolyse ou lipophagie sont utilisés par les mitochondries pour la production d'énergie via la β-oxydation et le cycle de Krebs.
Ce trafic se déroule au niveau des MCS LD-mitochondrie qui permettraient un passage rapide des lipides lors d'exercice par exemple, mais aussi pour prévenir la lipotoxicité.
Plusieurs protéines ont été impliquées dans la formation de ces MCS LD-mitochondrie.
Protéines SNARE
Les protéines SNARE SNAP23 et VAMP4 se localisent dans les LD.
La suppression de SNAP23 produit une diminution à la fois des MCS LD-mitochondries et de la β-oxydation (Long-chain acyl-CoA synthetase 1 interacts with key proteins that activate and direct fatty acids into niche hepatic pathways 2018).
- ACSL1 (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), une acyl-CoA synthétase qui dirige les FA vers les mitochondries pour la β-oxydation, interagit avec SNAP23 et VAMP4 dans les hépatocytes.
- La privation de glucose, une condition qui stimule l'oxydation des FA, favorise la co-immunoprécipitation de SNAP23, VAMP4 et ACSL1 dans les hépatocytes.
VPS13D
VPS13D, de la famille des VPS13 (Vacuolar Protein Sorting 13) transfère les FA des LD aux mitochondries au niveau des MCS entre ces organites.
1. Sa structure est composée de trois régions.
- Sa région N-terminale est responsable du ciblage mitochondrial.
- Un LTD (Lipid Transfer Domain) supposé à son extrémité N-terminale se lie aux FA pour le transfert.
- Sa région C-terminale à domaine DH-like (DHL) contient un domaine ATG2_C formé deux hélices amphipathiques (AH) qui s'attachent aux LD.
2. VPS13D recrute ESCRT-I, la sous-unité de l'ESCRT (Endosomal Sorting Complex Required for Transport ou complexe de tri endosomal requis pour le transport), qui modifie la courbure de la membrane des MCS (An ESCRT-dependent step in fatty acid transfer from lipid droplets to mitochondria through VPS13D−TSG101 interactions 2021).
- Son domaine VAB (Vps13 Adaptor Binding) interagit avec TSG101/Vps23, une protéine de la tige de ESCRT-I pour le recrutement de TSG101 dans les MCS LD-mitochondries.
- De plus, la localisation du domaine VAB et de TSG101/Vps23 entraîne la formation d'une structure resserrée ou tubulaire à la surface des LD.
Une suppression de VPS13D ou TSG101 entraîne une réduction significative du transfert de FA.
Remarque : VPS13D intergit aussi au niveau des contact avec les mitochondries pour inhiber la mitofusine MFN2 (Vmp1, Vps13D, and Marf/Mfn2 function in a conserved pathway to regulate mitochondria and ER contact in development and disease 2021).
Périlipine 1 (Plin1)
La périlipine 1 (Plin1) forme des MCS dans le tissu adipeux brun par des interactions directes avec avec la mitofusine 2 ou MFN2 (Mfn2 is critical for brown adipose tissue thermogenic function 2017).
- MFN2 et son homologue MFN1 sont des GTPases qui interviennent dans fusion des membrane externes mitochondriales.
- MFN2 est aassi impliquée dans les sites de contact mitochondries-RE (The cell biology of mitochondrial membrane dynamic 2020).
L'augmentation des contacts LD-mitochondries par MFN2-PLIN1 facilite le couplage de l'hydrolyse des triglycérides (TG) avec l'oxydation des FA lors de l'exposition du tissu adipeux brun au froid.
Rôle dans l'expansion des LD
Les MCS LD-mitochondrie peuvent également fonctionner dans l’expansion de LD dans des conditions favorisant le stockage des lipides.
1. Dans le tissu adipeux brun, une sous-population de mitochondries est étroitement associée aux grandes LD et présente plusieurs particularités (Mitochondria Bound to Lipid Droplets Have Unique Bioenergetics, Composition, and Dynamics That Support Lipid Droplet Expansion 2019) :
- une augmentation de l'activité du cycle de Krebs, des activités de synthèse de l'ATP et d'oxydation du pyruvate,
- une activité de β-oxydation réduite,
- une incorporation accrue de acides gras (FA) libres (FFA) dans les triglycérides (TG) dans les processus dépendants de l'ATP synthase.
Ainsi, la formation des MCS LD-mitochondrie est associée au stockage des lipides et à la génération d'énergie par oxydation du glucose et non des FA, i.e. en fournissant de l'ATP pour la synthèse de l'acyl-CoA pendant la production de TG.
2. La périlipine (Plin5) est impliquée dans les interactions physiques entre les cLD et les mitochondries dans les tissus oxydatifs (Mitochondria Bound to Lipid Droplets Have Unique Bioenergetics, Composition, and Dynamics that Support Lipid Droplet Expansion 2018 et Lipid Droplets and the Management of Cellular Stress 2019).
- La surexpression de Plin5 favorise des associations étroites entre les cLD et les mitochondries,
- La fusion des 67 acides aminés C-terminaux de Plin5 à Plin2 peut lier les CLD et les mitochondries, mais un motif de 20 acides aminés dans Plin5 est minimalement essentiel, mais n'est pas suffisant (Perilipin 5, a lipid droplet-associated protein, provides physical and metabolic linkage to mitochondria 2011).
a. Les interactions de Plin5 facilitent la canalisation efficace des FA des cLD vers les mitochondries contrôlée par la signalisation PKA et la modulation ultérieure des interactions ATGL et CGI-58/ABHD5 ( Plin et lipolyse).
b. Toutefois, dans les muscles squelettiques humains, PLIN2 et PLIN5 se localisent dans les LD sur des sites distincts, avec une abondance de PLIN5 sur les sites d'attache LD-mitochondries.
Les protéines PLIN ne serviraient pas de barrières lipolytiques mais plutôt de sites d'accueil pour les protéines facilitant l'accès sélectif à la lipase dans diverses conditions lipolytiques (Super-resolution microscopy localizes perilipin 5 at lipid droplet-mitochondria interaction sites and at lipid droplets juxtaposing to perilipin 2 2018).
c. On ignore si PLIN5 intervient directement dans l'attachement des gouttelettes lipidiques et des mitochondries par le biais d'une association avec une protéine mitochondriale spécifique ou avec la membrane mitochondriale.
MCS LD-peroxysomes
Les MCS LD-peroxisomes sont mal connus et les études sont très actives à l'heure actuelle (Peroxisomal Membrane Contact Sites in Mammalian Cells 2020).
Les LD sont liées aux peroxysomes pour prévenir l'accumulation de lipides peroxydés suite à un stress oxydatif (Spastin tethers lipid droplets to peroxisomes and directs fatty acid trafficking through ESCRT-III 2019).
Spastine M1
Le rôle canonique de la spastine est de sectionner les microtubules ( fission des microtubules).
La spastine est également l'une des nombreuses protéines impliquées dans les paraplégies spastiques héréditaires (HSP), une famille croissante de maladies génétiques associées à une pathologie neurologique et à la spasticité des membres inférieurs (Converging cellular themes for the hereditary spastic paraplegias 2018).
1. La spastine se présente sous deux isoformes, i.e. l'isoforme M1, plus longue que la M87, code pour un motif en épingle à cheveux hydrophobe N-terminal qui la cible sur les LD (Spastin Binds to Lipid Droplets and Affects Lipid Metabolism 2015).
2. La spastine M1 coordonne le trafic des acides gras (FA) des LD vers les peroxysomes par le biais de deux mécanismes interdépendants (Spastin joins LDs and peroxisomes in the interorganelle contact ballet 2019).
a. Elle forme, via sa région d'interaction avec les peroxysomes (PXI) qui se trouve au milieu de la protéine, un complexe d'attache avec le transporteur ABC, ABCD1 peroxysomal pour favoriser la formation de contact LD-peroxysome.
Les ABCD transporte aussi les acides gras à longue chaîne (LCFA) dans les peroxysomes.
b. Elle recrute les protéines d'ESCRT-III, IST1 et CHMP1B façonnant la membrane dans les LD via son domaine MIT pour faciliter le trafic d'acides gras (FA) du LD vers le peroxysome, éventuellement via des modifications dépendantes de IST1 et CHMP1B dans la morphologie de la membrane LD.
PEX5
La protéine peroxysomale PEX5 accompagne l'ATGL (Adipose TriGlycéride Lipase) vers les LD pour médier la lipolyse induite par le jeûne (Spatiotemporal contact between peroxisomes and lipid droplets regulates fasting-induced lipolysis via PEX5 2020 et Peroxisomal-PEX5 Controls Fasting-Induced Lipolysis 2020).
La perturbation de ce complexe d'attache modifie aussi les contacts peroxysome-RE et empêche la croissance de la membrane peroxysomale, ce qui suggère que ce site de contact est nécessaire pour transférer les lipides du RE vers les peroxysomes.
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