Fusion membranaire : protéines SNARE
Protéines Qb/c-SNARE : SNAP (vue d'ensemble)
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: trafic vésiculaire
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Les SNAP, (Synaptosomal-Associated Protein), Q-SNARE, i.e. contenant une glutamine (Q) dans la couche 0 du motif SNARE, sont des Qb/c-SNARE car elles contiennent deux domaines SNARE. Elles font partie des t-SNARE (t pour target, cible).
Les protéines SNARE forment quatre sous-familles conservées au cours de l'évolution :
- les v-SNARE (v pour vésiculaire), qui sont pour la plupart des R-SNARE,
- les t-SNARE (t pour target, cible) qui sont pour la plupart des Q-SNARE( infos sur la nomenclature).
Vue d'ensemble
des SNAP
Les SNAP (Synaptosomal-Associated Protein), suivis de leur masse en KDa, le KDA correspond à mille fois la masse d'un atome d'hydrogène des mammifères, comprend quatre homologues (The SNAP-25 Protein Family 2019).
1. SNAP-25 est impliquée dans l'exocytose régulée du système nerveux et dans les cellules neuroendocrines, où un déclenchement rapide dépendant du Ca++ est nécessaire pour synchroniser la libération avec un signal électrique.
- Elle est régulée par l'épissage alternatif, la phosphorylation et par la liaison aux protéines G.
- Elle régule les canaux Ca++, la survie neuronale et le développement des dendrites post-synaptiques.
2. SNAP-23 est impliquée dans la majorité des autres cas d'exocytose régulée, comme celle des macrophages, des plaquettes ou lors de trafic des transporteurs du glucose.
SNAP-23 est principalement régulée par la phosphorylation dans le lien reliant Qb à Qc.
Remarque : SNAP-25 et SNAP-23 pourraient en partie se remplacer l'un l'autre dans le système nerveux (SNAP-25 et SNAP-23).
3. SNAP-29 est impliquée dans :
- l'exocytose constitutive,
- la fusion des autophagosomes/lysosomes.
4. SNAP-47 est impliquée dans :
- le trafic des récepteurs AMPA du glutamate, i.e. leur insertion postsynaptique,
- la fusion des autophagosomes/lysosomes.
Structure des SNAP
1. Les SNAP (Synaptosomal-Associated Protein), Q-SNARE, i.e. contenant une glutamine (Q) dans la couche 0 du motif SNARE, sont des t-SNARE (t pour target, cible).
Dans le complexe SNARE, elle servent de Qb et de Qc, d'où leur appellation de Qb/c-SNARE car elles contiennent deux domaines SNARE. et participent à 2 des 4 hélices du complexe SNARE .
2. Le lien (linker) entre les deux domaine SNARE est long.
3. Les SNAP ne possèdent pas de domaine transmembranaire (TM) et doivent être arrimés à la membrane plasmique par d'autres processus.
- SNAP-23 et SNAP-25 s'arriment à la membrane par palmitoylation de quatre cystéines localisées dans le lien entre les deux domaines SNARE.
- SNAP-29 et SNAP-47, qui ne possèdent pas de cystéines palmitoylées, s'associent aux membranes par l'intermédiaire de leurs partenaires SNARE.
SNAP-25
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