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Système endomembranaire
Réticulum endoplasmique (RE)
Stress du RE et UPR

Sommaire
  1. En construction

 

définition

La réponse UPR (Unfolded Protein Response) est associée au stress du réticulum endoplasmique (RE) provoqué par des protéines à conformation anormale qui s’y accumulent.

Repliement des protéines

Dans tous les compartiments cellulaires, le repliement correct des protéines est essentiel au maintien de l'homéostasie cellulaire (The mitochondrial UPR - protecting organelle protein homeostasis 2010).

La majorité des protéines sécrétées et membranaires sont synthétisées dans le réticulum endoplasmique rugueux où elles sont repliées et assemblées avant d’être transportées.

1. Au cours de la traduction dans le RE rugueux, environ un tiers des protéines immatures est orienté vers sa lumière et subit des modifications nécessaires à l’acquisition de leur structure tertiaire et de leur fonction : N-glycosylation, ajout de ponts disulfures, oligomérisation, phosphorylation… (The endoplasmic reticulum: structure, function and response to cellular signaling 2015).

a. La maturation requiert la participation d’un ensemble spécifique de protéines chaperonnes dont GRP78 (Glucose Related Protein 78, appelée aussi, BiP ou Binding Protein) qui appartient à la famille des Hsp70 (Heat Shock Protein 70).

b. Les Hsp70 font partie de la famille des protéines de choc thermique ou protéines de stress (HSP ou Heat-Shock Protein), i.e. protéines produites par les cellules en réponse à un stress (The human HSP70 family of chaperones: where do we stand? 2016 et The nucleotide exchange factors of Hsp70 molecular chaperones 2015) :

  • en particulier, lors de leur découverte, à la dénaturation thermique, d'où leur nom,
  • mais aussi au froid, aux UV ou pendant la cicatrisation des plaies ou le remodelage des tissus.

c. Les HSP70 fonctionnent en tandem avec des protéines adaptatrices appelées protéines à domaine J (loupedomaine J).

bien

Les Hsp70, et, en particulier Hsc70, impliquée dans le déshabillage des vésicules de cltahrine, sont étudiées dans un chapitre spécial.

Mécanisme des Hsp70
Mécanisme des Hsp70
(Figure : vetopsy.fr d'après Kampiga et coll)

2. Le mécanisme canonique des Hsp70 serait le suivant (Étude de l’expression du stress du réticulum endoplasmique au cours de l’inflammation systémique aiguë chez l’homme 2021).

  • 1) Les protéines à domaine J se lient aux protéines clientes (non repliées).
  • (2) Le complexe protéine J/cliente recrute la chaperonne HSP70.
  • (3) L’hydrolyse de l’ATP permet un changement de conformation de la protéine HSP70 qui enserre la protéine cliente et la stabilise.
  • (4) Recrutement du facteur d’échange nucléotidique (NEF).
  • (5) Dissociation de l’ADP et
  • (6) recrutement d’une nouvelle molécule d’ATP.
  • (7) Dissociation du complexe HSP70/protéine cliente/NEF.

Remarque : la protéine cliente a alors une probabilité de trouver une conformation native lors de la dissociation, sinon, un nouveau cycle sera débuté jusqu’à l’obtention d’une conformation native ou du ciblage au protéasome.

Réponse UPR (unfolded protein response)

Dans les conditions physiologiques, le nombre de protéines chaperonnes du RE est supérieur à celui des protéines immatures afin d’éviter leur agrégation et de permettre une maturation satisfaisante.

1. En cas d’échec de maturation, les protéines mal repliées sont :

  • exportées vers le cytoplasme via des systèmes d’export localisés à la membrane du RE comme l'ERAD, i.e. complexe de dégradation associé au réticulum ou ER-Associated Degradation,
  • dégradées par la voie du protéasome.

Chez les mammifères, la réponse UPR inclut une activation de la transcription de gènes cibles et une profonde inhibition de la traduction, ce qui augmente les capacités de repliement et de dégradation et limite l’arrivée de nouvelles protéines dans le réticulum endoplasmique.

1. L'UPR vise à rétablir l’homéostasie par trois processus :

  • l’augmentation de la synthèse des protéines chaperonnes,
  • la limitation de la traduction protéique globale et
  • l’activation des voies de dégradation protéique.

2. L’UPR repose sur trois voies de signalisation impliquant des protéines transmembranaires du RE :

  • la voie IRE1α (Inositol-Requiring Protein-1 alpha),
  • la voie PERK (Protein Kinase RNA (PKR)-like ER Kinase),
  • la voie ATF6 (Activating Transcription Factor 6).

a. Dans les conditions physiologiques, ces trois protéines transmembranaires sont maintenues sous forme inactive à la membrane par interaction avec la GRP78.

b. Lors du stress du RE, la GRP78 est réquisitionnée dans la lumière du RE pour le repliement des protéines immatures accumulées et se dissocie de ces protéines effectrices, ce qui permet leur activation (Roles of Endoplasmic Reticulum Stress in Immune Responses 2018).

Les trois voies de signalisation de l'UPR
Les trois voies de signalisation de l'UPR
(Figure : vetopsy.fr d'après So)

UPR du RE

La majorité des protéines sécrétées et membranaires sont synthétisées dans le réticulum endoplasmique rugueux où elles sont repliées et assemblées avant d’être transportées.

Le stress du RE est impliqué dans :

  • le dysfonctionnement des cellules endothéliales,
  • les pathologies inflammatoires aiguës,
  • les maladies neurodégénératives…

UPR des mitochondries

Un contrôle de qualité essentiel se situe au niveau moléculaire, i.e. au niveau des protéines intramitochondriales, et comprend l'induction transcriptionnelle de l'expression des protéines chaperons nécessaires au pliage de ces protéines.

bien

La réponse UPR mitochondriale est étudiée dans un chapitre spécial.

Blocage de PKA par CAV1 lors de stress du réticulum endoplasmique (RE)
Blocage de PKA par CAV1 lors de stress du réticulum endoplasmique (RE)
(Figure : vetopsy.fr d'après Bravo-Sagua et coll)

UPR des gouttelettes lipidiques

Les gouttelettes lipidiques (LD ou Lipid Droplets) sont impliquées dans la régulation du stress du réticulum endoplasmique (RE) et dans l'élimination des agrégats de protéines (Friend or Foe: Lipid Droplets as Organelles for Protein and Lipid Storage in Cellular Stress Response, Aging and Disease 2020).

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