Enzymes
Groupe des hydrolases (EC 3)
Phosphatases : lipide phosphatases
Phosphatidylinositol 3-phosphatases (PI 3-phosphatases)
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Les PI 3-phosphatases sont des phosphatidylinositol phosphatases (PI phosphatases) qui retirent le groupe phosphate de l'hydroxyle 3 du noyau de l'inositol des phosphoinositides.
Le focus précoce sur les PI-phosphatases provient de la découverte du second messager IP3 (Inositol(1,4,5)P3) dans les années 1980.
Vous pouvez lire : The structure of phosphoinositide phosphatases: Insights into substrate specificity and catalysis (2015) et Phosphatidylinositol Kinases and Phosphatases in Entamoeba histolytica (2019).
Le centre catalytique des deux groupes de PI 3-phosphatases contient le motif CX5R, également présent dans les protéines tyrosine phosphatases.
Classifiaction des PI 3-phosphatases
Les PI 3-phosphatases sont classées en deux groupes en fonction des spécificités du substrat.
1. Un premier groupe comprend :
- PTEN (Phosphatase and TENsin homolog), essentiel comme gène suppresseur de tumeur,
- TPIP (TPTE and PTEN homologous Inositol lipid Phosphatase).
PTEN et TPIP ont des domaines catalytiques similaires, mais diffèrent par la spécificité de leur substrat.
- PTEN enlève le groupe phosphate en position 3 de PI(3,4,5)P3 et PI(3,4)P2, d'où son rôle essentiel.
- Les TPIP déphosphorylent tous les phosphoinositides en position 3 (TPIP : a novel phosphoinositide 3-phosphatase 2001).
Remarque : on trouve un troisième membre, TPTE (Transmembrane Phosphatase with Tensin Homology), qui (sic) n'a pas d'activité phosphatase et dont le rôle fonctionnel est obscur, même si TPTE est associée à certains comme celui de la prostate ou des poumons.
2. Le deuxième groupe comprend les myotubularines (MTM) qui retire le groupe phosphate en position 3 de PI(3)P, et de PI(3,5)P2, i.e. ce dernier rôle étant fortement discuté.
3-phosphoinositides, PI 3-kinases et PI-3 phospholipases
Pour essayer de se faire une idée globale des 3-phosphoinositides, des PI 3-kinases et des PI-3 phospholipases, ce chapitre est entièrement repris de : Phosphatidylinositol 3-phosphates—at the interface between cell signalling and membrane traffic (2016).
1. Au niveau de la membrane plasmique, l'activation du récepteur tyrosine kinase entraîne la production de PI(3,4,5)P3 via les PI3KC de classe Ia.
PI(3,4,5)P3 est un substrat pour :
- la PI 3-phosphatase PTEN,
- les PI 5-phosphatases SHIP1/2 et OCRL.
2. La PIK3C2α (PI3K de classe II) génère un pool membranaire plasmique de PI(3,4)P2 nécessaire à la maturation de la fosse recouverte de clathrine (CCP) et à la formation de vésicules recouvertes de clathrine (CCV) libres pendant l'endocytose ( endocytose clathrine-dépendante).
3. PI(3)P est une caractéristique déterminante et essentielle des endosomes précoces.
Il est généré :
- principalement par le complexe PIKC3-CIII, i.e. Vps34 avec une contribution possible des PI3K de classe II,
- soit par synthèse directe de PI(3)P ou indirectement via l'hydrolyse de PI(3,4)P2 par les PI 4-phosphatases, i.e. INPP4A/B.
4. Au fur et à mesure de la maturation des endosomes, les endosomes précoces se transforment en endosomes tardifs/endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB), PI(3)P est converti en PI(3,5)P2 via la PIPKIII PIKfyve.
- Les endosomes et les lysosomes abritent également un pool mal compris de PI(3,4)P2.
- Dans le foie, ce pool endosomal de PI(3,4)P2 est synthétisé par une PIK3 de classe II, PIK3C2γ.
5. Les autophagosomes contiennent du PI(3)P produit par :
- le complexe I Vps34 spécifique à l'autophagosome,
- éventuellement les PI3K de classe II.
5. Le recyclage endosomal à la surface cellulaire nécessite :
- l'hydrolyse de PI(3)P par les phosphatases myotubularines (MTM) telles que MTM1,
- la génération concomitante de PI(4)P pour permettre l'exocytose.
6. Le renouvellement de PI(3,5)P2 au niveau des MVB et/ou des lysosomes est médié par les myotubularines (MTM) et la 5-phosphatase Fig4/SAC3.
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