Enzymes
Groupe des hydrolases (EC 3)
GTPases : DSP (superfamille de la dynamine)
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La superfamille de la dynamine (DSP : Dynamin Superfamily Proteins) comprend de nombreuses GTPases, de grande taille par rapport aux petites GTPases, d'où quelquefos leur nom de grandes GTPases, et à faible affinité pour les nucléotides guanidiques.
Ces molécules s'assemblent en réseaux polymériques régulés par leur activité GTPasique stimulée par l'assemblage.
Les membres de cette famille participent à de nombreuses fonctions dont les principales sont :
- 1. la fission des vésicules :
- 2. la fusion :
- des mitochondries (ou des chloroplastes),
- des tubules endoplasmiques (Fusion of the endoplasmic reticulum by membrane-bound GTPases 2016) ;
- 3. la fission :
- des mitochondries,
- des peroxisomes ;
- 4. la division cellulaire ;
- 5. la transmission synaptique et la contraction musculaire.
Classification
La superfamille DSP (Dynamin Superfamily Proteins) comprend :
- la dynamine,
- des DRP (Dynamin-Related Proteins) antérieures, du point de vue de l'évolution, aux dynamines dites " classiques ".
On peut distinguer :
1. les DSP de fission, protéines cytosoliques recrutées de manière périphérique et réversible au niveau membranaire ;
2. les DSP de fusion, ancrés dans les membranes via des segments transmembranaires (TM) ;
OPA1, elle, protéine de fusion de la membrane mitochondriale interne (IMM), possèdent les caractéristiques des DSP de fission et de fusion.
3. les DSP d'échafaudage indépendants de la membrane comprennent :
- les DSP de résistance virale comme Mx (Myxovirus resistance) et GBP - Guanylate binding proteins - (Nucleotide-dependent farnesyl switch orchestrates polymerization and membrane binding of human guanylate-binding protein 2017 et Mx GTPases: dynamin-like antiviral machines of innate immunity 2014).
- mais aussi des DSP de fission comme Drp1 et la dynamine 2, qui forment des échafaudages hélicoïdaux en solution et ont des fonctions non membranaires comme la régulation du cytosquelette d'actine.
Fonction cellulaire | Nom | |
---|---|---|
DSP de fission | Fission des vésicules endocytaires et trafic de vésicules intracellulaires |
|
Fission mitochondriale |
|
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Fission chloroplastique | DRP5B (ARC5, plantes) | |
Fission peroxysomale | ||
Division cellulaire (cytokinèse) |
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DSP de fusion | Fusion mitochondriale |
|
Fusion des tubules du réticulum endoplasmique |
|
|
DSP d'échafaudage indépendants de la membrane | Résistance virale |
|
De toutes les DSP, la dynamine, découverte en 1989, première protéine à être impliquée dans les processus de fission, est la plus étudiée !