Système endo-lysosomal
Vue d'ensemble des endosomes
- Vue d'ensemble du système endomembranaire
- Endosomes
- Lysosomes
- Trafic des endosomes/lysosomes
- Fusion et fission membranaire
- Transport membranaire
- Moteurs moléculaires
- Voies de signalisation
Les endosomes, compartiments membranaires retrouvés à l'intérieur des cellules eucaryotes, sont des organites de tri majeur du système endomembranaire.
Le système endomembranaire est constitué par plusieurs compartiments.
1. Des organites, qui modifient enzymatiquement la sécrétion des cargos et les distribuent à d'autres organites, à la membrane plasmique, au cytosol et à l'espace extracellulaire, sont constitués par :
- le réticulum endoplasmique (RE), avec l'enveloppe nucléaire en continuité,
- le réseau trans-Golgi (TGN).
2. Le système endo-lysosomal, composé d'organites acides regroupant les endosomes et les lysosomes, implique des molécules extracellulaires et des composantes de la membrane plasmique.
Les endosomes forment l'interface entre la membrane plasmique, le trans-golgi (TGN), les lysosomes et le cytosol.
Vue d'ensemble des endosomes
1. Les endosomes des cellules eucaryotes sont un centre du contrôle de la réutilisation/dégradation des composants membranaires.
2. Ils régulent :
- l'absorption des nutriments,
- l'immunité,
- la signalisation,
- l'adhésion et la migration,
- le renouvellement et le développement de la membrane…
Vous pouvez lire : The enigmatic endosome - sorting the ins and outs of endocytic trafficking (2018) et Life in the lumen: The multivesicular endosome (2020).
Difficultés de la classification des endosomes
Généralement, les endosomes sont classés en trois grandes catégories :
- les endosomes précoces (Early Endosomes), dits aussi de tri ou de triage (Sorting Endosomes),
- les endosomes de recyclage (Recycling Endosomes),
- les endosomes tardifs (Late Endosomes).
La nomenclature est souvent difficile à comprendre car on prend mal en compte les compartiments intermédiaires : les scientifiques se sont vite aperçus que cette classification était simpliste.
Les vésicules endocytées sont formées au niveau de la membrane plasmique par plusieurs voies ( endocytose).
1. Les vésicules et les cargos qu'elles transportent fusionnent avec les endosomes précoces.
- Les endosomes précoces peuvent aussi fusionner les uns avec les autres grâce à la protéine d’arrimage EEA1 et les protéines SNARE.
- Par un processus encore mal connu, les endosomes précoces ne peuvent plus accepter les vésicules dérivés de la membrane plasmique (Endosome maturation 2011).
Des compartiments transitoires et très précoces dans la voie endocytaire, compartiments précurseurs des endosomes précoces, appelés pré-EE, VEE (Very Early Endosomes), endosomes initiaux ou parfois, vésicules entrantes ( endosomes initiaux et APPL1).
2. Les endosomes précoces contiennent des vésicules intraluminales (ILV), i.e. vésicules qui contiennent les cargos triés et qui se forment par invagination et pincement de la membrane endosomale.
L'accumulation des ILV faire prendre à l'endosome un aspect multivésiculaire, qui prend le nom d'endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB) immatures.
3. Les régions multivésiculaires se détachent ou mûrissent des endosomes précoces et deviennent des vésicules porteuses endosomales (ECV ou Endosomal Carrier Vesicle) et/ou des endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB)
Devenirs des endosomes
Les endosomes suivent trois voies principales.
1. Voie de la dégradation
En général Ils transportent les cargos vers les endosomes tardifs, enrichis par l'apport d'hydrolases des vésicules de transport en provenance du réseau trans-Golgi (TGN), puis vers les endo-lysosomes, i.e. compartiments hybrides entre endosomes tardifs et lysosomes, pour enfin atteindre les lysosomes pour leur dégradation.
Remarque 1 : les lysosomes peuvent aussi fusionner avec la membrane plasmique pour exocyter leur contenu ( exocytose lysosomale).
2. Voie rétrograde
Certains cargos sont acheminés par transport rétrograde ou centripète vers le réseau trans-Golgi (TGN).
Ils sont ensuite exportés vers la membrane plasmique par la voie sécrétoire qui peut être considérés comme une voie de recyclage.
3. Voies du recyclage
Les endosomes précoces et/ou les endosomes tardifs, peuvent fusionner avec la membrane plasmique pour être recyclés et/ou sécrétés dans le milieu extracellulaire sous la forme d’exosomes.
Le recyclage des cargos peut donc suivre ainsi plusieurs voies (Endocytic recycling 2004).
Quelle que soit la voie d'entrée dans les cellules, les cargos ont des itinéraires distincts dans le système endosomal lors de l'endocytose et peuvent être classées en six types selon les voies endocytaires connues ( devenir des vésicules endocytées).
1. Soit le recyclage est rapide (boucle courte), i.e. bourgeonnement direct des endosomes précoces pour rejoindre la membrane plasmique.
2. Soit le recyclage est lent (boucle longue), i.e. le matériel est acheminé vers des endosomes de recyclage plus spécialisés.
- Ces endosomes suivent un processus de bourgeonnement et de fission suivi du transport des structures tubulaires et/ou vésiculaires regroupés dans l'ERC (Endocytic Recycling Compartment) périnucléaire adjacent au MTOC ou MicroTubule-Organizing Center (Pathways and mechanisms of endocytic recycling 2009).
- Pour le recyclage lent, i.e. les endosomes ayant subi la fusion entre endosomes de recyclage et/ou l'ERC, un processus de bourgeonnement et de fission est supposé se reproduire, le transport des vésicules libérées vers la membrane plasmique se faisant le long des traces des microtubules.
Complexité
Outre la complexité des compartiments endosomaux, une autre complexité se rajoute du fait que :
- les vésicules intraluminales (ILV) proviennent de différentes sources (endocytose, phagocytose, pinocytose),
- les endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB) contiennent des compartiments d'origines diverses, i.e. exosomes en formation, ILV destinées aux lysosomes, restes d'organites délivrés par autophagie.
Bref ! Il est difficile de s'y retrouver : chaque chapitre essaiera, autant que faire ce peut, de faire le point. De plus, des cargos identiques peuvent suivre des voies différentes et les mécanismes qui contrôlent les ciblages et les destins alternatifs des endosomes et des vésicules intraluminales (ILV) sont complètement inconnus ( trafic du récepteur de la transferrine)
Particularités et compréhension des différents endosomes
Biologie cellulaire et moléculaireMembrane plasmiqueNoyauCytoplasmeMitochondriesSystème endomembranaireRéticulum endoplasmiqueAppareil de GolgiEndosomesLysosomesPeroxysomesProtéasomesCytosqueletteMicrofilaments d'actineFilaments intermédiairesMicrotubulesMatrice extracellulaireReproduction cellulaireBiochimieTransport membranaire Moteurs moléculairesVoies de signalisation