Lipides
Gouttelettes lipidiques
(Lipid droplets ou LD)
Périlipines
(Plins) : vue d'ensemble
- Biochimie
- Chimie organique
- Bioénergétique
- Composition de la matière vivante
- Composés organiques
- Protides
- Acides nucléiques
- Glucides
- Lipides
- Coenzymes
- Hormones
- Composés inorganiques
- Composés organiques
- Transport membranaire
- Moteurs moléculaires
- Voies de signalisation
Les périlipines sont une famille de protéines qui s'assemblent à la surface des gouttelettes lipidiques (LD), en particulier dans les adipocytes, qui joue un rôle dans leur formation et dans la mobilisation des lipides.
1. On trouve plus de 200 protéines sur les gouttelettes lipidiques (Lipid Droplets ou LD), dont certaines se localisent uniquement sur les LD, d'autres se trouvent également dans divers compartiments subcellulaires (The perilipin family of lipid droplet proteins: Gatekeepers of intracellular lipolysis 2017).
Les périlipines (Plin) sont les protéines les plus abondantes des gouttelettes lipidiques et aucune gouttelette lipidique cytosolique dépourvue de périlipines n'a encore été identifiée dans les cellules de mammifères.
2. Ainsi, partout où des lipides neutres sont stockés, deux ou plusieurs membres de la famille des protéines périlipines sont exprimés et se lient aux gouttelettes lipidiques.
Vue d'ensemble des périlipines
Les périlipines font partie d'une famille de gènes comprenant cinq membres chez les vertébrés (The Perilipins: Major Cytosolic Lipid Droplet–Associated Proteins and Their Roles in Cellular Lipid Storage, Mobilization, and Systemic Homeostasis 2016) :
- la péripiline 1 avec plusieurs isoformes, i.e. Plin1a (522 résidus chez l'homme, 517 chez la souris), 1b, 1c et 1d, principalement exprimée dans le tissu adipeux et constituant la protéine de revêtement la plus abondante de la surface des LD,
- la périlipine 2 (adipophiline ou ADRP, Adipose Differentiation-Related Protein), i.e 437 résidus chez l'homme, 425 chez la souris,
- la périlipine 3 (TIP47, Tail-Interacting Protein of 47 kDa), i.e 434 résidus chez l'homme, 437 chez la souris,
- la péripiline 4, i.e 1357 résidus chez l'homme, 1403 chez la souris,,
- la périlipine 5 (MLDP, LSDP5 ou OXPAT), i.e 463 résidus chez l'homme et la souris.
Remarque : PLIN1 de la levure stabilise les gouttelettes lipidiques et facilite leur assemblage.
2. Leur distribution tissulaire est régulée par les facteurs de transcription PPAR (Peroxisome Proliferator-Activated Receptors), excepté Plin3.
a. Les péripilines 2 et 3 sont exprimées de manière ubiquitaire (Adiposome Targeting and Enzymatic Activity of Lipid Droplet-Specific Proteins 2020).
b. Les périlipines 1, 4 et 5 ont une expression tissulaire plus limitée.
- Plin1a est spécifiquement exprimée dans les adipocytes.
- Plin1b, c, d, plus courtes que Plin1a sont exprimées dans les cellules stéroïdogènes.
- Plin4 est exprimé principalement dans les adipocytes, mais également dans le cœur et les muscles squelettiques.
- Plin5 est trouvée dans les tissus oxydatifs qui utilisent les acides gras comme source d'énergie, comme le cœur, les muscles, le foie et le tissu adipeux brun.
3. Leur association est aussi différenciée.
a. Les périlipines 1 et 2 sont uniquement associées à des gouttelettes lipidiques.
b. Les périlipines 3, 4 et 5 sont associées :
- soit à des gouttelettes lipidiques,
- soit à des lipoprotéines comme Plin3 et 5 (Distinct cellular pools of perilipin 5 point to roles in lipid trafficking 2012).
4. Les Plins, comme les apolipoprotéines, s'associent à des LD de composition différentes (Perilipin family members preferentially sequester to either triacylglycerol-specific or cholesteryl-ester-specific intracellular lipid storage droplets 2012).
- Plin1a, Plin2 et 5 s'associent à des LD riches en triglycérides (TG).
- Plin1c et 1d, plus courtes, et Plin4 s'associent à des LD riches en esters de cholestérol (CE).
Remarque : Plin2 et Plin3 sont présentes sur les gouttelettes lipidiques contenant des rétinoïdes i.e. composés dérivés de la vitamine A, de cellules stellaires hépatiques (HSC) de mammifères (Hepatic stellate cell lipid droplets : a specialized lipid droplet for retinoid storage 2010) et de cellules épithéliales pigmentaires rétiniennes (Retinyl ester storage particles (retinosomes) from the retinal pigmented epithelium resemble lipid droplets in other tissues 2011).
Structure des périlipines
Les Plins sont composées de trois régions principales.
Domaine PAT
Le domaine PAT (Périlipine, ADRP et TIP47) N-terminal, est composé d'une centaine de résidus et sa structure n'est pas encore élucidée.
- Ce domaine n'est pas impliqué dans le ciblage des LD (Lipid droplet targeting domains of adipophilin 2003).
- Le domaine PAT de Plin2 empêcherait la localisation de Plin3 dans les LD/Plin2 (Multiple functions encoded by the N-terminal PAT domain of adipophilin 2008).
- Plin4 n'aurait pas de séquence PAT.
Domaine 11-mer
Après le domaine PAT, on trouve une région composée de séquences répétées de 11 résidus (11-mer) qui forme une hélice amphipatique (AH) ciblant les LD (Conserved Amphipathic Helices Mediate Lipid Droplet Targeting of Perilipins 1–3 2016).
- Plin4 comprend une séquence 10 fois plus longue que les autres Plins, par l'insertion d'environ 900 résidus de 11-mer (A giant amphipathic helix from a perilipin that is adapted for coating lipid droplets 2018).
- Ces séquences sont retrouvées chez les synucléines et les apolipoprotéines.
Domaine C-terminal
Le domaine C-terminal varie énormément selon les Plins et différencient les isoformes de Plin1, i.e. Plin1b/c/d étant plus courts que Plin1a.
Ceux de Plin1, Plin2 et Plin3 peuvent également cibler les LD (Dual binding motifs underpin the hierarchical association of perilipins1–3 with lipid droplets 2019).
1. Le domaine C-terminal de Plin1 possède une région C-terminale supplémentaire par rapport aux autres Plins, responsable de l'interaction avec CGI-58/ABHD5.
2. La structure de l'extrémité C-terminale de Plin3, en forme de L a été déterminée (Structure of a Lipid Droplet Protein: The PAT Family Member TIP47 2004).
a. Le domaine alpha/bêta est de topologie inhabituelle.
b. Le faisceau de quatre hélices amphipathiques pourraient perturber les interactions protéine-protéine et interagir avec la surface lipidique, i.e. il ressemble au domaine de liaison de l'apoE au LDLR (LBD ou Ligand Binding Domain de LDLR).
c. Une profonde fente hydrophobe se forme entre le domaine α/β et le faisceau à quatre hélices qui permet les interactions moléculaires aussi bien avec des protéines qu'avec des lipides.
Cette fente est présente chez toutes les Plins, suggérant un rôle fonctionnel important, mais encore non identifié.
Fonctions des périlipines
Fonction de protection contre la lipolyse
Le rôle princeps des périlipines (Plin) est de protéger les gouttelettes lipidiques (LD) de la lipolyse.
1. Cette protection s'exerce aussi bien sur :
- la lipolyse " classique " ou neutre,
- la lipolyse autophagique ou lipolyse acide, i.e. macrolipophagie ou lipophagie.
a. Plin1 et Plin2 sont stabilisées lorsqu'elles se lient aux gouttelettes lipidiques et par exemple, Plin1 associée aux LD a une demi-vie très longue, supérieure à 72 heures.
b. Toutefois, lorsque Plin1 et Plin2 sont traduites en excès par rapport aux sites de liaison des gouttelettes lipidiques disponibles, elles sont instables et rapidement dégradées par les voies protéasomales ou lysosomales, en fonction du type de cellule et des facteurs environnementaux (Post-translational Regulation of Adipose Differentiation-related Protein by the Ubiquitin/Proteasome Pathway 2005).
2. Cette protection s'exercerait aussi lors de la formation des gouttelettes lipidiques, sans que l'on vraiment étudié le phénomène.
a. Les niveaux d’ARNm de Plin2 augmentent au cours de la différenciation des adipocytes, mais sont très faibles dans les adipocytes matures (Perilipin2 plays a positive role in adipocytes during lipolysis by escaping proteasomal degradation 2016).
- Plin1 a une plus forte affinité de liaison que Plin2 pour les gouttelettes lipidiques, i.e. Plin1 devient la principale périlipine associée aux LD pour la protection des triglycérides (TG) contre les lipases.
- La phosphorylation de Plin1 conduit à la libération d'acides gras (FA) et de diglycérides (DAG) et à une ré-estérification d'une partie de ces produits de lipolyse pour la formation de nouvelles gouttelettes lipidiques.
- Plin2 se lie à ces gouttelettes lipidiques naissantes, échappant ainsi à la dégradation protéasomale et contrôlant la lipolyse.
b. Plin3, rapidement remplacée par Plin2, et Plin4 semblent aussi présentes sur des LD naissantes.
3. Enfin, les Plins permettraient aux cLD d'entrer en expansion (The Perilipins: Major Cytosolic Lipid Droplet–Associated Proteins and Their Roles in Cellular Lipid Storage, Mobilization, and Systemic Homeostasis 2016).
- Elles agissent sur des processus physicochimiques, d’une manière similaire à celle des particules d’apolipoprotéines et de lipoprotéines.
- Toutefois, la taille du CLD n’est pas uniquement fonction de la charge cellulaire en TG ( expansion des LD).
Périlipines et sites de contact membranaire (MCS)
Les sites de contact membranaire (MCS) sont des régions d'apposition étroite (≤ 30 nm) entre deux organites, établissant des microdomaines qui permettent un échange de matériel.
Outre le réticulum endoplasmique (RE), les péripilines jouent un rôle dans la formation des MCS :
- LD-mitochondries, par Plin5 e Plin1 avec la MFN2,
- LD-lysosomes, par Plin2 et Plin3 impliquées dans la CMA (Chaperone-Mediated Autophagy).
Les MCS des LD sont étudiés dans un chapitre spécial.
Périlipines et lipolyse
BiochimieChimie organiqueBioénergétiqueProtidesGlucidesLipidesAcides grasLipides vraisLipides vrais simplesLipides vrais complexesLipoïdesCholestérolGlycéridesPhospholipidesTrafic non vésiculaire et LTPDigestion et absorption entérocytaire des lipidesLipoprotéinesApolipoprotéinesGouttelettes lipidiques (LD)EnzymesCoenzymesVitaminesHormonesComposés inorganiquesTransport membranaireMoteurs moléculairesVoies de signalisation