Dans une protéine, une répétition est un bloc de séquence peptidique reproduit plus d'une fois dans l'ensemble de la séquence de la protéine, à l'identique ou de manière très semblable.
Exemples de solénoïdes
(Figure : vetopsy.fr d'après Bubus12)
Vue d'ensemble
En général,
ces répétitions contiennent de 30 à 40 résidus qui peuvent prendre une forme particulière, en particulier solénoïdale.
On peut trouver des répétitions plus courtes, mais qui ont une structure désordonnée. C'est le cas par exemple des :
Les résidus d'interaction protéine/protéine, dispersés sur les deux protéines, sont rarement spécifiques à la répétition.
Exemples de solénoïdes
(Figure : vetopsy.fr d'après Bubus12)
Les extrémités N-terminale et C-terminale peuvent être allongées par de nouvelles répétitions ou raccourcies par l'élimination de certaines d'entre elles, sans que cela ait un impact significatif sur la stabilité de l'ensemble du domaine (Evolution of protein structures and functions 2002).
Solénoïdes circulaires (fermés)
Un solénoïde fermé est une structure protéique dont les répétitions N- et C-terminales entrent en interaction.
Ces solénoïdes sont circulaires, en forme de roue.
On peut citer comme exemple le tandem de domaines BRCT (after the C-terminal domain of a breast cancer susceptibility protein) de la protéine BRCA (breast cancer 1) et MDC1 (mediator of DNA damage checkpoint protein 1).