Acides aminés
Vue d'ensemble

Les acides aminés sont très bien décrits sur Wikipedia : nous ne les détaillerons pas et dans vetopsy.fr, nous renverrons à chaque fois à leur description sur cette plateforme.

1. Plus de 500 acides aminés naturels ont été découverts et constituent les briques des peptides ( Norine, database des peptides).

2. 22 apparaissent dans le code génétique :

• 20 ont leurs propres codons,
• 2 ont des mécanismes de codage spéciaux : sélénocystéine présente chez tous les eucaryotes et pyrrolysine présente chez certains procaryotes.

Classification des acides aminés

Les acides aminés sont classés de différentes manières, i.e. en fonction de :

1. la position du groupe amine par rapport au groupe carboxyle en distinguant par exemple les acides α-aminés, β-aminés, γ-aminés ou δ-aminés,

2. leur polarité, i.e. façon dont les charges électriques négatives et positives sont réparties dans une molécule ou une liaison chimique,

3. leur ionisation,

4. leur nature :

• 

  aliphatique, i.e. dont la chaîne latérale consiste en une succession de groupes éthyl (-CH₂CH₃) et méthyl (-CH₃)
• aromatique,
• cyclique,
• à chaîne ouverte.

5. la présence de groupes fonctionnels autres que le carboxyle (-COOH) et l'amine (-NH) qui définissent cette classe de composés.

Remarque : les acides aminés sont retrouvés sous deux formes ( chiralité et énantiomères) :

• les L ou lévogyres bien plus abondants, i.e. la lumière est déviée vers la gauche d'un angle -α,
• les D ou dextrogyres bien plus rares, i.e. appelés aussi α, la lumière est déviée vers la droite d'un angle α.

Liste des acides aminés principaux

Acide aminé	Symboles		Chaîne latérale
	3	1	Classe	Polairité	Charge à pH 7,4
Alanine	Ala	A	Aliphatique	Non polaire	Neutre
Arginine	Arg	R	Cation fixe	Basique polaire	Positive
Asparagine	Asn	N	Amide	Polaire	Neutre
Acide aspartique (aspartate)	Asp	D	Anion	Base de Brønsted	Négative
Cystéine	Cys	C	Thiol	Brønsted acid	Neutre
Glutamine	Gln	Q	Amide	Polaire	Neutre
Acide glutamique (glutamate)	Glu	E	Anion	Base de Brønsted	Négative
Glycine	Gly	G	Aliphatique	Non polaire	Neutre
Histidine	His	H	Cation Aromatique	Acide et base de Brønsted	Positive (10%) Neutre (90% )
Isoleucine	Ile	I	Aliphatique	Non polaire	Neutre
Leucine	Leu	L	Aliphatique	Non polaire	Neutre
Lysine	Lys	K	Cation	Acide de Brønsted	Positive
Méthionine	Met	M	Thioéther	Non polaire	Neutre
Phénylalanine	Phe	F	Aromatique	Non polaire	Neutre
Proline	Pro	P	Cyclique	Non polaire	Neutre
Sérine	Ser	S	Hydroxylique	Polaire	Neutre
Thréonine	Thr	T	Hydroxylique	Polaire	Neutre
Tryptophane	Trp	W	Aromatique	Non polaire	Neutre
Tyrosine	Tyr	Y	Aromatique	Acide de Brønsted	Neutre
Valine	Val	V	Aliphatique	Non polaire	Neutre