La répétition TPR (TetratricoPeptide Repeat) est un motif structurel présent dans des réseaux en tandem, structurant les interactions protéine-protéine et, souvent, l'assemblage de complexes protéiques. Le domaine 13-3-3 en est probablement l'évolution.
Structure des protéines TPR
(Figure : vetopsy.fr d'après Main et coll)
Sur les 34 positions de la répétition TPR, les positions canoniques 8, 20 et 27, qui sont impliquées dans les contacts inter-hélicoïdaux, sont les moins variables et sont généralement occupées par des résidus d’alanine ou de glycine.
Les résidus conservés aux positions 4, 7, 11, 24 et 32 sont également souvent limités à un sous-ensemble d’acides aminés, bien que plusieurs d’entre eux favorisent de grandes chaînes latérales aromatiques (par exemple les positions 4, 11 et 24) et qu’ils soient également impliqués dans l’interaction entre les deux hélices de la répétition.
D’autres positions sont plus tolérantes à la substitution.
Une structure TPR typique est caractérisée par des interactions entre les hélices A et B du premier motif et l'hélice A' du TPR suivant.
Bien que la nature de ces interactions puisse varier, les deux premières hélices du motif TPR ont généralement un angle de -24°.
Liaison HSP90/AIP
(Figure : vetopsy.fr d'après Morgan et coll)
b. Les répétitions de plus de trois motifs TPR génèrent une superhélice droite caractérisée à la fois par une face concave et une face convexe, i.e. la face concave est habituellement impliquée dans la liaison des ligands.
Structures des protéines 14-3-3
(Figure : vetopsy.fr d'après Obsilova et coll)
2. Les protéines 14-3-3 sont sous forme dimérique et chaque protomère comporte :
neuf hélices antiparallèles (H1-H9),
un site de liaison aux phosphopeptides.
a. Le dimère forme une particule en forme de godet, avec une double symétrie, qui présente un canal central formé par les hélices H3, H5, H7 et H9.
De plus, ce canal central contient deux rainures de liaison au ligand.
b. Les résidus qui forment la surface interne du dimère qui comprend les deux rainures de liaison au ligand sont fortement conservés, tandis que les résidus qui forment la surface à l'extérieur du canal central présentent une grande variabilité.
Protéines 14-3-3
Les protéines 14-3-3 forment une famille de molécules d'échafaudage hautement conservées, exprimées chez tous les eucaryotes, où elles modulent la fonction d'autres protéines, principalement par phosphorylation.
Leur nom provient de leur profil d'élution spécifique dans les fractions de filtration sur gel et de leur position sur l'électrophorèse ultérieure sur gel d'amidon lors de leur découverte.
Seipine et remodelage du cytosquelette d'actine
(Figure : vetopsy.fr d'après Wee et coll)
1. Les protéines 14-3-3 sont une famille de modules de liaison à la phosphosérine et à la phosphothréonine, qui contrôlent presque tous les processus physiologiques de la cellule.
2. Compte tenu de leur profil d'expression omniprésent dans tous les tissus, les protéines 14-3-3 constituent des échafaudages universels qui façonnent la structure et la fonction de nombreuses cibles protéiques différentes et participent à toutes les principales voies de signalisation cellulaire.
Les protéines d'échafaudage 14-3-3 participent à de nombreux processus cellulaires clés :
3. À ce jour, plus de 1200 partenaires de liaison des protéines 14-3-3 ont été identifiés, notamment des protéines kinases, des phosphatases, des protéines G, des récepteurs et des facteurs de transcription, impliqués dans l'apparition de diverses maladies (Intrinsic disorder associated with 14-3-3 proteins and their partners 2019).
exemples) :
