Glucides
Nucléotides-oses
Vue d'ensemble
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- Transport membranaire
- Moteurs moléculaires
- Voies de signalisation
Les nucléotides-oses (nucleotide sugars en anglais) sont des nucléotides liés à des oses qui constituent la forme activée de ces oses.
Rôles des nucléotides-oses
Les nucléotides-oses interviennent :
- dans l'interconversion entre oses,
- comme donneur d'unités glycidiques lors de :
- la biosynthèse des osides,
- la glucurono-conjugaison traitée avec les acides uroniques,
-
la glycosylation des protéines, traitée dans des chapitres spéciaux.
Luis Federico Leloir
Remarque : l'autre donneur d'unités glucidiques est le dolichol phosphate.
C'est Luis Federico Leloir (1906-1987) qui mit le premier en évidence le rôle de l'UDP-glucose lors de la transformation du glucose en galactose.
Vous pouvez lire : Nucleotide Sugars in Chemistry and Biology (2020).
Principaux nucléotides-oses
Les nucléotide-oses ou nucléoside-diphospho-sucres sont des composés formés par :
- un ose-1-phosphate, i.e. aldose, et jamais cétose,
- un nucléoside monophosphate-5' lié par l'intermédiaire d'une liaison pyrophosphate (ou phosphoanhydride).
Les nucléotide-oses constituent la forme activée des oses, car la liaison entre le carbone 1 de l'ose et le reste phosphorique est une liaison " riche en énergie ".
UDP-glucose (UDP-Glc)
1. L'UDP-glucose (UDP-Glc) ou uridine diphosphate glucose, principal nucléotide-ose, à l'origine de la plupart des autres, est obtenu selon la réaction :
$\ce{Glucose-1-P + UTP}$ $\leftrightharpoons$ $\ce{UDP-glucose + P-Pi}$
(Figure : vetopsy.fr)
dans laquelle :
- le glucose-1 phosphate uridyltransférase ou UDP-glucose pyrophosphorylase (EC 2.7.7.9) catalyse la réaction,
- le glucose-1-phosphate provient de la conversion du glucose-6-phosphate par la phosphoglucomatase (EC 5.4.2.2),
- le pyrophosphate (P-Pi) instable est hydrolysé par une pyrophosphatase (EC 3.6.1.-) pour donner 2 Pi, rendant ainsi la réaction irréversible.
2. On peut obtenir tous les autres nucléotides-oses à partir du glucose.
Autres nucléotides-oses
Outre l'UDP-glucose, on trouve d'autres nucléotides-oses.
1. Des UDP-oses sont construits avec l'uridine-diphosphate :
- l'UDP-galactose (UDP-Gal), qui peut aussi s'obtenir par une réaction similaire à celle de l'UDP-glucose par une galactose-1-phosphate uridylyltransférase (EC 2.7.7.12),
- l'UDP-xylose (UDP-Xyl),
- l'UDP-GlcNAc, i.e. UDP-N-acétylglucosamine,
- l'UDP-GalNAc, i.e. UDP-N-acétylgalactosamine,
- l'UDP-GlcA, i.e. UDP-acide glucuronique.
2. Des GMP-oses sont synthétisés avec des guanidine-diphosphates comme :
- le GDP-mannose (GDP-Man), impliqué dans la N-glycosylation,
- le GDP-fucose.
3. Un CMP-ose contient une cytidine monophosphate, i.e. CMP-Neu5Ac, i.e. CMP-acide N-acétylneuraminique.
Remarque : il existe aussi un cytidine-diphosphate, i.e. le CDP-ribitol, le ribitol étant un pentose-alcool issu de la réduction du ribose, et non un ose.
Synthèse des nucléotides-oses
Nous n'aborderons que les grands principes car le sujet est trop vaste et nous verrons quelques exemples au cours des chapitres de biochimie.
En simplifiant, la biosynthèse des nucléosides-oses s'effectue selon trois grands types de réactions.
1. La phosphorylation de l'ose est effectuée par une kinase et utilise 2 NTP, i.e. nucléotide-triprosphate comme l'UTP ( cf. au-dessus) :
$\ce{Ose + NTP}$ $\leftrightharpoons$ $\ce{Ose-P + UTP}$ $\leftrightharpoons$ $\ce{NDP-ose}$
Exemple : Glucose → Glucose-6-P → Glucose-1-phosphate → UDP-glucose
2. Un NDP-ose est produit par un autre NDP-ose selon de multiples voies, i.e épimérisation, oxydation, décarboxylation… :
$\ce{NDP-ose(1)}$ $\leftrightharpoons$ $\ce{NDP-ose(2)}$
Exemples :
- UDP-N-acétylglucosamine → UDP-N-acétylgalactosamine
- UDP-N-acide-glucuronique → UDP-xylulose
3. Une réaction d'échange de nucléotides peut avoir lieu :
$\ce{NDP-Ose(1) + Ose(2)-1-P}$ $\leftrightharpoons$ $\ce{NDP-Ose(2) + Ose(1)-1-P}$
Exemple : Galactose-1-P + UDP-glucose → Glucose-1-P → UDP-galactose
(Figure : vetopsy.fr d'après Lester Heath)
Remarque : les codes couleurs sont ceux employés pour la nomenclature des glycanes.