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Acides nucléiques
Chromatine : chromosomes : centromère
Complexe Mis18 et HJURP : incorporation de CENP-A

Sommaire
définition

L’incorporation de CENP-A correspond au processus d’assemblage de la variante histonique centromérique dans la chromatine, assurant la transmission épigénétique de l’identité du centromère par des mécanismes hautement régulés impliquant HJURP et le complexe Mis18.

Pour préserver l'identité du centromère, les niveaux de CENP-A doivent être maintenus par un mécanisme actif d'incorporation au cours du cycle cellulaire.

Le principal acteur de l'incorporation de CENP-A est le complexe Mis18, qui recrute la protéine chaperonne spécifique HJURP (Holliday Junction Recognition Protein).

Complexe Mis18

Structure du complexe Mis18

Le complexe Mis18, composé de Mis18α, Mis18β et Mis18BP1 (KNL2), joue un rôle fondamental dans l’assemblage de la chromatine centromérique en amont du dépôt de CENP-A.

  • Mis18α/β forme un hétéro-hexamère comprenant 4 copies de Mis18α et 2 copies de Mis18β.
  • Le N-terminal Mis18BP1 interagit avec l’hétéro-hexamère Mis18α/β via l’hétéro-dimère MeDiY pour former un assemblage hétéro-octamérique.
  • Les sites de phosphorylation consensuels du complexe cycline B/CDK1 (MPF) au sein de Mis18BP1 sont impliqués dans la formation du complexe.

1. Mis18α et Mis18β contiennent tous deux un domaine globulaire appelé domaine Yippee suivi d'une hélice α C-terminale.

2. De plus, Mis18α a une région α-hélicoïdale N-terminale supplémentaire qui n'est pas présente dans Mis18β et qui se replie et interagit avec le triple faisceau hélicoïdal formé par les deux α-hélices C-terminales de Mis18α et celle de Mis18β.

Complexe Mis18
Complexe Mis18
(Figure : vetopsy.fr d'après Thamkachy et coll)

3. Mis18BP1, une protéine multi-domaines d'environ 1132 résidus, dont la structure est encore mal connue, comprend :

Interfaces du complexe Mis18

De multiples interfaces inter- et intramoléculaires stabilisent l’architecture tridimensionnelle globale du complexe Mis18 et assurent la localisation du centromère et le fonctionnement de la machinerie de dépôt de CENP-A.

1. L'hétéro-oligomérisation du complexe Mis18α, Mis18β est effectuée via :

a. les modules MeDiY qui comprennent deux copies de Mis18α et une copie de Mis18β.

Les modules MeDiY sont des sous-structures du domaine Yippee, i.e. domaine protéique conservé, présent dans plusieurs protéines eucaryotes, impliqué dans les interactions protéine/protéine et la régulation de complexes nucléaires (Centromere localization and function of Mis18 requires Yippee‐like domain‐mediated oligomerization 2016).

b. le faisceau hélicoïdal triple C-terminal de de Mis18α/β qui stabilise l’hétéro-oligomérisation en formant le cœur du complexe essentiel pour générer l’assemblage hétéro-octamérique fonctionnel.

Domaines Yippee de Schizosaccharomyces pombe
Domaines Yippee de Schizosaccharomyces pombe
(Figure : vetopsy.fr d'après Subramanian et coll)

2. Les modules MeDiY servent de plateforme pour l’interaction avec l'extrémité N-terminale de Mis18BP1, conduisant à la formation de l’assemblage hétéro-octamérique du complexe Mis18 (Molecular basis for CDK1‐regulated timing of Mis18 complex assembly and CENP‐A deposition 2017).

a. Mis18BP1 entre en interaction par deux régions :

  • un court segment hélicoïdal, résidus 109–130, qui se lie à une poche hydrophobe du domaine Mis18α,
  • une région, résidus 20-51, contenant deux brins β courts qui interagissent à l'interface Yippee Mis18α/β prolongeant les feuillets à six brins β des domaines Yippee de Mis18α et Mis18β.

b. Mis18BP1 est phosphorylé sur deux sites de ces régions, Thr40 et Ser110, par le complexe cycline B/CDK1 (MPF), appelé par la suite CDK1.

Remarque : en outre, la phosphorylation de T653 ou T654 de Mis18BP1 par CDK1 est susceptible de perturber l’interaction de Mis18BP1 avec CCAN (loupe plus loin).

c. L’effet fonctionnel de ces phosphorylations est d’empêcher la formation prématurée du complexe Mis18 pendant la mitose.

bien

La déphosphorylation à la sortie de mitose, lorsque l’activité de CDK1 chute, permet le recrutement de Mis18BP1 sur Mis18α/β, ouvrant la voie au dépôt de CENP-A en début de G1, première phase de l'interphase qui suit la mitose, strictement limité à cette fenêtre temporelle.

Complexe Mis18 et mitose
Complexe Mis18 et mitose
(Figure : vetopsy.fr d'après Spiller et coll)

Interaction Mis18/centromère

bien

Les mécanismes de recrutement du complexe Mis18 au centromère restent encore débattus.

1. Le réseau CCAN (Constitutive Centromere-Associated Network) pourrait y être associé par ses sous-unités CENP-C et du CENP-I qui semblent des acteurs majeurs de la localisation du complexe Mis18 au centromère.

2. Dans le complexe Mis18, la perturbation de l'interface Mis18α/β-Mis18BP1, et en particulier celle de Mis18α, a complètement aboli la localisation au centromère et réduit les niveaux centromériques de Mis18BP1 (Structural basis for Mis18 complex assembly and its implications for centromere maintenance 2024).

Ces observations indiquent que Mis18α est recrutée au centromère principalement par l'intermédiaire de Mis18BP1 et que l'intégrité du complexe Mis18 est indispensable à une localisation centromérique efficace.

HJURP : protéine chaperonne CENP-A/H4

Structure de HJURP

HJURP (Holliday Junction Recognition Protein) est une protéine chaperonne histonique qui reconnaît spécifiquement le dimère CENP-A/H4 et en assure le ciblage vers les régions centromériques (Advances in holliday junction recognition protein (HJURP): Structure, molecular functions, and roles in cancer 2023).

1. HJURP comprend quatre domaines :

  • un domaine N-terminal SCM3 (suppressor of chromosome missegregation protein 3), i.e. 16-68, qui se lie à CENP-A,
  • un domaine intermédiaire central HMD (HJURP middomain), i.e. 271-386 qui se lie directement à l'ADN et participe au chargement de CENP-A aux centromères,
  • un domaine HCTD1 (HJURP C-terminal domain 1) ou R1, i.e. 409-471, dont la déphosphorylation joue un rôle dans le recrutement de CENP-A,
  • un domaine HCTD2 ou R2, i.e. 554-614, qui contribue à la dimérisation.

Remarque : R1 et R2 se lient au complexe Mis18 (loupe incorporation de CENP-A).

HJURP et interaction avec CENP-A/H4
HJURP et interaction avec CENP-A/H4
(Figure : vetopsy.fr d'après Hu et coll)

2. Le domaine SCM3, homologue de Scm3 de la levure, interagit directement, par un motif TLTY, avec le domaine CATD de CENP-A pour permettre son incorporation dans les nucléosomes centromériques (HJURP Uses Distinct CENP-A Surfaces to Recognize and to Stabilize CENP-A/Histone H4 for Centromere Assembly 2012).

Toutefois, les résidus de CATD enfouis qui génèrent de la rigidité avec H4 sont également nécessaires pour une incorporation efficace dans les centromères.

3. R1 est phosphorylé par CDK1 (Cyclin-dependent kinase 1) sur Ser412, Ser448 et Ser473 pendant la majorité du cycle cellulaire et déphosphorylé à la fin de la mitose.

4. R2 assure la dimérisation du HJURP, un événement essentiel pour le chargement centromérique du CENP-A (Dimerization of the CENP-A assembly factor HJURP is required for centromeric nucleosome deposition 2013).

  • Ceci est réalisé par la liaison d'un homodimère HJURP à un hétérodimère CENP-A-/H4.
  • Lors de sa dimérisation, HJURP peut recruter deux hétérodimères CENP-A/H4, permettant l'assemblage d'un nucléosome octamérique.

5. HJURP :

Interaction HJURP/Mis18

1. Le faisceau hélicoïdal triple C-terminal de Mis18α/β, constitué de deux molécules de Mis18α et d'une molécule de Mis18β, sert de plateforme pour recruter HJURP et les complexes CENP-A/H4.

Mis18α peut se localiser au centromère indépendamment de Mis18β, mais cette dernière est indispensable à un chargement efficace de CENP-A.

Deux modèles de recrutement de HJURP et dépôt de  dimères CENP-A/H4
Deux modèles de recrutement de HJURP et dépôt de dimères CENP-A/H4
(Figure : vetopsy.fr d'après Pan et coll)

2. Cependant, des séquences similaires de résidus entre la région N-terminale de Mis18α et les répétitions R1 et R2 de HJURP sont impliquées aussi dans l'interaction avec Mis18α/β (Mechanism of centromere recruitment of the CENP-A chaperone HJURP and its implications for centromere licensing 2019).

  • La suppression de la région N-terminale de Mis18α a amélioré l’interaction HJURP avec le complexe Mis18.
  • La région hélicoïdale N-terminale de Mis18α entre en contact avec les hélices C-terminales de Mis18α et de Mis18β.

La région N-terminale de Mis18α peut directement interférer avec l’interaction complexe HJURP–Mis18.

Mécanisme global de l'incorporation

Une fois recrutés au centromère, le complexe Mis18 et HJURP coordonnent l'incorporation de nouveaux nucléosomes contenant CENP-A selon une succession d'événements finement régulés au cours du cycle cellulaire.