Domaines des protéines
Domaine PEST
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Les domaines ou séquences PEST sont des régions de 10 à 60 résidus, riches en proline (P), en acide glutamique (E), en sérine (S) et en thréonine (P), d'où leur nom.
Ces régions sont flanquées par deux acides aminés chargés positivement :
- la lysine (K),
- l'arginine (R) ou l'histidine (H).
Protéines à demi-vie courte
1. Au départ, cette séquence a été associée à des protéines à demi-vie intracellulaire courte.
il a été supposé que la séquence PEST agissait comme un domaine d'instabilité des protéines.
2. En outre, dans un certain nombre de protéines, les domaines PEST semblaient fonctionner comme sites d'ancrage des E3 ubiquitine ligases.
Cette dégradation des protéines peut être effectuée par le protéasome ou la calpaïne.
Protéines à demi-vie longue
1. Les domaines PEST ont également été trouvés dans de nombreuses protéines à longue durée de vie.
Des fonctions supplémentaires ou alternatives leur ont été attribuées comme dans :
- le tri intracellulaire,
- la liaison à l'E2 Ube21, ancien Ubc9, de SUMO,
- la liaison à des récepteurs comme les récepteurs calciques ou potassiques (Large Putative PEST-like Sequence Motif at the Carboxyl Tail of Human Calcium Receptor Directs Lysosomal Degradation and Regulates Cell Surface Receptor Level 2012 et Identification of a PEST Sequence in Vertebrate KIR2.1 That Modifies Rectification 2019).
2. Les séquences PEST sont retrouvées dans :
- certaines phophatases comme PTEN,
- des canaux potassiques comme Kir2,1, qui modifie la rectification de son courant,
- la voie de signalisation Notch, récepteurs esentiels dans la signalisation intercellulaire dans le développement embryonnaire et les cancers mammaires (PEST Domain Mutations in Notch Receptors Comprise an Oncogenic Driver Segment in Triple-Negative Breast Cancer Sensitive to a γ-Secretase Inhibitor 2015).
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