Domaines protéiques
Domaine WW
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Le domaine WW (rsp5-domain ou WWP repeating motif) est un domaine qui interagit avec des ligands protéiques : il est proche des domaines SH2, SH3 (Src-Homology2 et 3), PH (Pleckstrin-Homology) et PTB (PhosphoTyrosine-Binding).
Ce domaine est trouvé, sur le site vetopsy.fr, dans :
- la dystrophine,
- de enzymes comme les E3 ubiquitiine ligases (NEDD4L, Smurf1 et 2) ou Pin1 (PPIase, Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerase), qui est requise pour la reconnaissance des motifs Ser/Thr pour leur phosphorylation.
- des co-activateurs transcriptionnels comme YAP (Yes-associated protein, car elle se lie au domaine SH3 de Yes et aux Src protéine-tyrosine kinases)…
La YAP, protéine présente dans le cytoplasme, migre, avec la protéine TAZ, vers le noyau par l'allongement du cytosquelette provoqué par des contraintes mécaniques d'étirement. Elle active des gènes particuliers de la croissance cellulaire. Yap contient un TAD (transcription activation domain) et un TID (TEAD transcription factor interacting domain).
Structure du domaine WW
Le domaine WW est un des plus petits, composé seulement de 40 acides aminés, qui régule les interactions avec des protéines contenant des motifs riches en proline.
- Ce domaine comprend 2 tryptophanes hautement conservés (W), d'où son nom, espacé de 20 à 22 résidus.
- Le domaine WW se replie selon un feuillet β (β sheet) antiparallèle à trois brins.
WW se lie au motif proline-tyrosine (PPxY) des protéines sans les phosphoryler, comme par exemple :
- le PY du linker de la Smad 7 (Structural basis for the versatile interactions of Smad7 with regulator WW domains in TGF-β pathways 2012)
- le PPxY des protéines de YAP.
WW peut aussi se lier au motif :
- LPxY (où L est la leucine ),
- phospho-sérine-proline (p-SP) ou phospho-thréonine-proline (p-TP) pour réguler les phosphorylations…
Fonctions du domaine WW
Le domaine WW agit dans :
- la reconnaissance des protéines pour leur ciblage ou leur dégradation,
- la co-activation transcriptionnelle,
- les voies de signalisation comme la voie de signalisation Hippo (ou SWH, Salvador/Warts/Hippo) qui contrôle la taille des organes (régulation de la prolifération cellulaire et de l'apoptose). La voie tire son nom de l'un de ses principaux composants : la protéine kinase Hippo (Hpo).