Domaines protéiques
Domaine WW

Les domaines WW et SH3 peuvent potentiellement se lier à des sites qui se chevauchent.

Structure du domaine WW

1. Le domaine WW est un domaine de 40 résidus environ, qui régule les interactions avec des protéines contenant des motifs riches en proline.

• 

  Ce domaine comprend 2 tryptophanes (W) hautement conservés , d'où son nom, espacé de 20 à 22 résidus.
• Le domaine WW se replie selon un feuillet β (β sheet) antiparallèle à trois brins en double épingle à cheveux.
• Il n’a pas de noyau hydrophobe conventionnel, mais a à la place deux plaques hydrophobes qui sont partiellement exposées au solvant à l’état natif.

2. Le type I de WW se lie au motif proline-tyrosine (PPxY) des protéines, i.e. dans 52 protéines chez l'homme, comme par exemple :

• le PY du linker de Smad7 (Structural basis for the versatile interactions of Smad7 with regulator WW domains in TGF-β pathways 2012),
• le PPxY des protéines de YAP.

Remarque : il peut aussi se lier au motif LPxY (où L est la leucine).

3. Le type II de WW peut aussi se lier au motif phospho-sérine-proline (p-SP) ou phospho-thréonine-proline (p-TP) pour réguler les phosphorylations…

4. Ce domaine se trouve peut être répété jusqu’à quatre fois dans certaines protéines comme par exemple dans la voie signalisation Hippo, comme dans YAP, TAZ, KIBRA, and SAV1 (Decoding WW domain tandem-mediated target recognitions in tissue growth and cell polarity 2019).

Fonctions du domaine WW

1. Le domaine WW agit dans :

• la reconnaissance des protéines pour leur ciblage ou leur dégradation,
• la co-activation transcriptionnelle,
• les voies de signalisation comme la voie de signalisation Hippo (ou SWH, Salvador/Warts/Hippo) qui contrôle la taille des organes (régulation de la prolifération cellulaire et de l'apoptose). La voie tire son nom de l'un de ses principaux composants : la protéine kinase Hippo (Hpo).

2. Ce domaine est trouvé, sur le site vetopsy.fr, dans :

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  la dystrophine,
• des enzymes comme les E3 ubiquitiine ligases (NEDD4L, Smurf1 et 2) ou Pin1 (PPIase, Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerase), qui est requise pour la reconnaissance des motifs Ser/Thr pour leur phosphorylation.
• des co-activateurs transcriptionnels comme YAP (Yes-associated protein, car elle se lie au domaine SH3 de Yes et aux Src sérine-tyrosine kinases)…

La YAP, protéine présente dans le cytoplasme, migre, avec la tafazzine, vers le noyau par l'allongement du cytosquelette provoqué par des contraintes mécaniques d'étirement. Elle active des gènes particuliers de la croissance cellulaire. Yap contient un TAD (transcription activation domain) et un TID (TEAD transcription factor interacting domain).

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