Domaines protéiques à doigt de zinc
Domaines NZF

Le domaine NZF (Npl4 Zinc Finger), motif à doigt de zinc, est retrouvé dans plus de 100 protéines impliquées, en général, dans les processus dépendant de l'ubiquitine.

Structure du domaine NZF

Le domaine NZF, d'environ 35 acides aminés, est composé :

• de 4 brins β anti-parallèles reliés par trois boucles autour d'un site de liaison métaliique (domaine zinc-ribbon - domaine rubredoxin-like -) à 4 cystéines.
• Le motif consensus est : X₄-W-X-Cys-X₂-Cys-X₃-N--X₆-Cys-X₂-Cys-X₅

Fonctions du domaine NZF

1. Les domaines NZF se lient, en général, à l'ubiquitine (mono ou polyubiquitine).

Cette liaison s'effectue sur son patch hydrophobe (autour de Ile44) par la séquence TFX₁₀Φ, dans laquelle Φ est un résidu hydrophobe (Structure and Ubiquitin Interactions of the Conserved Zinc Finger Domain of Npl4 2003 et Ubiquitin interactions of NZF zinc fingers 2004).

2. D'autres protéines ne se lient pas à l'ubiquitine.

C'est le cas de certaines nucléoporines par exemple comme Nup-358 pour se lier aux petites GTPases Ran dans leur conformation RanGDP (Two distinct classes of Ran-binding sites on the nucleoporin Nup-358 1999).