Transport membranaire : voie sécrétoire
Modèles du trafic intra-Golgien (IGT) : DM et KARM
De nombreux modèles différents et leurs combinaisons ont été proposés pour expliquer les données expérimentales sur le transport réticulum/Golgi (EGT).
À L'heure actuelle, quatre principaux modèles de transport intracellulaire, reposent sur trois grands principes, i.e. dissociation, progression et diffusion, sont décrits :
- le modèle vésiculaire (VM),
- le modèle de maturation-progression des citernes (CMPM),
- le modèle de diffusion (DM),
- le modèle kiss-and-run (KARM), qui existe sous forme de deux variantes, symétrique et asymétrique.
Vous pouvez l'article qui a inspiré ce chapitre : Models of Intracellular Transport: Pros and Cons (2019) et Comparison of the Cisterna Maturation-Progression Model with the Kiss-and-Run Model of Intra-Golgi Transport: Role of Cisternal Pores and Cargo Domains (2022).
Modèle de diffusion (DM)
1. Le modèle de diffusion (DM) montre que les citernes de l'appareil de Golgi sont bien connectées entre elles et que le transport de protéines solubles peut s'effectuer par diffusion via des continuités intercisternales (Direct continuities between cisternae at different levels of the Golgi complex in glucose-stimulated mouse islet beta cells 2004 et Secretory traffic triggers the formation of tubular continuities across Golgi sub-compartments 2004).
- Ces connexions sont remplies d'albumine, i.e. protéines sécrétoires solubles (Transport of soluble proteins through the Golgi occurs by diffusion via continuities across cisternae 2013).
- Certains lipides peuvent être facilement transportés le long de la voie de sécrétion lorsque la formation de vésicules est inhibée (Transport through the Golgi Apparatus by Rapid Partitioning within a Two-Phase Membrane System 2008)..
Ce modèle coexisterait avec le modèle de maturation-progression des citernes (CMPM) pour les agrégats comme le protocollagène.
Des connexions inter-citernes se forment lorsqu'un cargo arrive au Golgi parce que le Ca++ est libéré et du Golgi et du réticulum endoplasmique (The SPCA1 Ca2+ Pump and Intracellular Membrane Trafficking 2010).
Cette libération conduit à la fusion de vésicules COPI enrichies en Qb SNARE avec des citernes de Golgi, et à la restauration du complexe SNARE du Golgi.
2. Toutefois, des observations contredisent le DM :
- la concentration des cargos diffusibles, i.e. les gradients protéiques, lipidiques et ioniques à travers les empilements de saccules du Golgi,
- l'importance des protéines SNARE à chaque étape du transport, sans justification car il n'y a ni fusion, ni fission,
- la rareté des connexions,
- la présence d'empilements de saccules sans connections pendant le transport,
- les concentrations croissantes de cargos, y compris les mégacargos qui ne peuvent pas diffuser le long des connexions intercisternales étroites (Transport of soluble proteins through the Golgi occurs by diffusion via continuities across cisternae 2014) pendant l'EGT (Endoplasmic reticulum Golgi Transport) et l'IGT,
- les gros agrégats de cargos ne peuvent diffuser le long du compartiment intermédiaire.
Modèle KARM (Kiss-And-Run Model)
Vue d'ensemble
1. Pour résoudre toutes ces contradictions, le modèle KARM (Kiss-And-Run Model) est un modèle qui est utilisé dans un bon nombre de processus comme (The Kiss-and-Run Model of Intra-Golgi Transport 2012) :
- le comportement des vésicules synaptiques (Synaptic vesicles: is kissing a matter of competence? 2001 et Synaptic Vesicle Exocytosis 2011),
- la libération des hydrolases des lysosomes vers les endo-lysosomes, les phagosomes, les autolysosomes ou les mélanosomes.
Le KARM ne nie ni le modèle de diffusion (DM), ni le modèle de maturation cisternale (CMPM).
2. Le principe de base de KARM est que la fusion précède la fission, et que et même cette fusion entraîne la fission ( principes de base du KARM).
La fusion/fission peut se produire :
- sur un même site, i.e. variante symétrique du KARM,
- sur des sites différents , i.e. variante asymétrique du KARM, appelé aussi modèle de maturation des transporteurs (CMM ou carrier-maturation model),
L'IGT selon le KARM est bien décrit dans : Comparison of the Cisterna Maturation-Progression Model with the Kiss-and-Run Model of Intra-Golgi Transport: Role of Cisternal Pores and Cargo Domains (2022).
3. Les processus du KARM asymétrique pourraient être les suivantes.
- (A) Formation du complexe SNARE composé de v- et t-SNARE entre le mégacargo contenant les distensions cisternales et le bord de la citerne distale.
- (B) Fusion entre les distensions et le rebord correspondant.
- (C–F) Intégration de la distension dans la citerne distale.
- (G) Allongement de la première citerne.
- (H-I) Remplacement des SNARE et formation du nouveau complexe SNARE composé d'un autre ensemble de SNARE.
- (J) Fusion de la distension contenant le cargo située dans la deuxième citerne avec le rebord de la troisième citerne contenant un pore.
- (K – O) Cycles supplémentaires de processus de fusion/fission.
Prérequis du KARM
Le KARM est basé sur certains prérequis qui sont en partie démontrés dansComparison of the Cisterna Maturation-Progression Model with the Kiss-and-Run Model of Intra-Golgi Transport: Role of Cisternal Pores and Cargo Domains (2022).
1. La concentration des cargos et mégacargos est supérieure du côté trans du Golgi.
2. Les différents cargos et mégacargos membranaires forment des domaines différents.
- Les distensions des saccules contenant des mégacargos représentent déjà des domaines de fret.
- Des pores peuvent être observés entre les distensions contenant le PCI et le reste des citernes.
Les domaines de fret sont séparés du reste des citernes de Golgi par des rangées de pores ou de tubules minces, comme sites de fission ultérieure, même si les fonctions des pores restent inconnues.
3. Les protéines SNARE sont concentrés dans ces domaines de fret, i.e. pendant l'IGT, les SNARE travaillant du côté cis du Golgi enrichis sur les domaines de fret sont remplacés par des SNARE, qui fonctionnent du côté trans du complexe de Golgi.
- La concentration des cargos et des SNARE augmente l'efficacité.
- Les pores ou les tubules minces derrière un domaine de cargaison fournissent la direction.
GS27 et GS28 sont enrichies sur le vésicules COPI du Golgi, alors que Bet1, GS15, Ykt6 et la syntaxine 5 (Stx5) étaient appauvries. Ykt6, Bet1 et GS15 sont enrichis sur des domaines de fret, Stx5 sur les bords des saccules conventionnels.
Au cours de l'IGT, la concentration de cis-SNARE sur les domaines de fret a augmenté.
- Puis, les cis-SNARE ont été remplacés par les trans-SNARE.
- Les SNARE ont été enrichis sur les domaines de fret situés dans la citerne de Golgi proximale la plus proche.
En revanche, les GGE et Stx5, enrichis au niveau des rebords cisternaux correspondants, potentialisent la progression et la glycosylation des cargos (Golgi Enzymes Are Enriched in Perforated Zones of Golgi Cisternae but Are Depleted in COPI Vesicles 2004).
La plupart des distensions des citernes de Golgi contenant des cargos sont séparées du reste des citernes de Golgi par des pores.
4. Le nombre de citernes du Golgi médian est constant, indépendamment de la quantité de cargos se déplaçant à travers le complexe de Golgi.
- Le CMPM qui présuppose qu'après l'arrivée soudaine de différentes quantités de cargaison, le nombre de citernes de Golgi médianes peut augmenter en fonction de ces quantités de cargos.
- L'arrivée des cargos augmente la longueur, la surface et du volume des saccules , bien que le nombre de citernes médiales soit resté constant
5. Les pores cisternaux sont consommés pendant l'IGT.
Les vésicules COPI pourraient générer les tubules et les pores (Trans-Membrane Area Asymmetry, Budding, Fission and Organelle Geometry 2020).
- Après leur formation COPI-dépendante et leur fusion consécutive avec les citernes, les vésicules COPI génèrent l'excès de courbure membranaire qui conduit à la formation de tubules puis à la fusion arrière de la pointe avec la citerne, ce qui pourrait restaurer les pores cisternaux.
- COPI participe également à la fission des tubules qui séparent les pores dans la rangée de pores.
COPI est aussi impliqué dans :
- la séparation des membranes porteuses RE-Golgi du RE pour provoquer la sortie des GGE du RE et pour leur concentration (Mutant p53 induces Golgi tubulo-vesiculation driving a prometastatic secretome 2020).
- l'extraction des SNARE Qb des citernes de Golgi.
- la formation de vésicules de 50 nm au niveau de l'ERES (Visualization of secretory cargo transport within the Golgi apparatus 2019),
7. L'observation principale en contradiction avec le KARM provient du fait que les compartiments séparés du Golgi ne seraient pas attachés les uns aux autres et ne pourraient donc pas fusionner.
En effet, chez S. cerevisiae, tous les compartiments de Golgi sont localisés loin les uns des autres.
- Cependant, il existe des connexions entre différents compartiments de Golgi (Three-dimensional and immune electron microscopic analysis of the secretory pathway in Saccharomyces cerevisiae 2016),
- Le cargo et les domaines de Golgi peuvent être situés dans le même disque à membrane perforée (Visualization of secretory cargo transport within the Golgi apparatus 2019).
Mécanisme de IGT
selon le KARM
Le mécanisme de l'IGT selon le KARM serait le suivant.
1. La formation du ruban (ribbon en anglais) de cargos s'effectue par :
- l'arrivée des domaines cargo et de leur fusion conduisant à un ruban parallèle,
- le bourgeonnement des domaines de fret des citernes de Golgi.
2. Dans le KARM asymétrique, le domaine cargo fusionne avec les rebords cisternaux contenant plusieurs pores (B-C).
- Le domaine cargo fusionne avec la citerne distale avec le tubule (DE)
- Les tubules dans la zone où se trouvaient les pores se disloquent (F).
- Le tubule reliant le domaine cargo et la citerne proximale subit une fission (G).
- Puis, on assiste à l'arrivée du TGN, sa fusion avec le domaine cargo (H) et la fission consécutive du tubule reliant le domaine cargo et la citerne distale (I).
À l'heure actuelle, il existe plus de 20 variantes des 4 modèles principaux et les modèles pourraient ne pas être incompatibles (Models of Intracellular Transport: Pros and Cons 2019).
Comparaison CMPM/KARM d'après Beznoussenko et coll | |||
---|---|---|---|
Observation | Modèle | ||
CMPM | KARM | Démonstration | |
Formation de domaine | Neutre | Souhaité | Oui |
Concentration accrue de SNARE dans la membrane des domaines de fret |
Neutre | Souhaité | Oui |
Pores autour des domaines de fret | Neutre | Souhaité | Oui |
Enrichissement des cargos du côté trans du Golgi |
Interdit | Possible | Oui |
Stabilité du nombre de citernes médiales lors du transport intra-golgien |
Interdit | Souhaité | Oui |
Augmentation de la concentration d'enzymes Golgiennes (GGE) dans les vésicules COPI |
Souhaité | Neutre | Non |
Isolement complet des compartiments de Golgi chez S. cerevisiae |
Neutre | Interdit | Non |
Fusion temporelle du compartiment de Golgi hétérogène chez S. cerevisiae |
Neutre | Souhaité | Oui |
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