Domaines protéiques
Domaines protéiques à doigt de zinc
Domaine PHD
Le domaine PHD, appelé aussi PHD finger, est un domaine proche du domaine RING et FYVE.
(Figure : vetopsy.fr d'après Chakravarty)
Ce domaine Cys4-His-Cys3 a été découvert chez des homéodomaines des plantes (HAT3), d'où son nom (Plant HomeoDomain).
Structure
On le retrouve seul ou, le plus souvent, en groupe de 2 ou 3 comme les chromodomaines et bromodomaines.
- Le domaine PHD est un domaine globulaire à 2 brins β et une hélice α.
- Deux atomes de zinc stabilisent le domaine par des cystéines et une histidine.
Rôles
Les doigts PHD ont récemment été divisés en trois groupes (Structure and Site-Specific Recognition of Histone H3 by the PHD Finger of Human Autoimmune Regulator 2009) :
- ceux qui se lient spécifiquement à la K4 non modifiée de H3,
- ceux qui reconnaissent la K4 triméthylée de H3,
- ceux qui ne reconnaissent pas les histones (Yng1 PHD Finger Binding to H3 Trimethylated at K4 Promotes NuA3 HAT Activity at K14 of H3 and Transcription at a Subset of Targeted ORFs 2006).
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