Citation
« Afin de survivre en ce monde, il faut accepter de lâcher prise. »
David Levithan
Documentation web
Pendant la translocation du substrat dans la chambre catalytique, plusieurs processus arrivent concomitamment :
La désubiquitination du substrat se produit en même temps que la translocation et dépend du cycle ATPasique.
Le protéasome ne dégrade pas les ubiquitines (au moins 4) du substrat, mais il les clive pour les recycler.
Rpn11, une désubiquitinase (DUB) de la famille des MNP/JAMM, est au coeur de ce processus.
1. Dans les protéasomes libres de tout substrat, Rpn11 est situé sur le côté de l'anneau OB de la base, au-dessus de la superhélice des Rpt5/4.
2. Lors du déplacement du " couvercle " dans l'engagement du substrat, Rpn11 se décale de 18 Å, si bien que son site catalytique se positionne face au canal central (Conformational switching of the 26S proteasome enables substrate degradation 2013)
Ce processus est ATP-dépendant et est couplé à la translocation du substrat dans la chambre catalytique, qui automatiquement positionne correctement la chaîne d'ubiquitine et le site catalytique : ce processus prévient le retrait prématuré de l'ubiquitine à partir d'un substrat qui n'est pas encore engagé.
Des DUB supplémentaires peuvent s'associer de manière réversible au protéasome.
Ubp6 de la levure interagit avec la base du protéasome.
Uch37 des mammifères se retrouve aussi dans INO80, régulateur de la transcription et la réparation d'ADN (Distinct Modes of Regulation of the Uch37 Deubiquitinating Enzyme in the Proteasome and in the Ino80 Chromatin-Remodeling Complex 2008).
Le domaine C-terminal de Rpn13 se lie au domaine C-terminal autoinhibiteur de Uch37, qui est lié par son domaine N-terminal à Rpn2 (Structural Basis for the Activation and Inhibition of the UCH37 Deubiquitylase 2014).
USP14 des mammifères aurait un rôle similaire (Enhancement of Proteasome Activity by a Small-Molecule Inhibitor of Usp14 2010).
Hul5/KIAA10, une E3 ubiquitine ligase HECT, qui déploie les chaînes d'ubiquitine sur le protéasome, pourrait coopérer avec ces DUB, mais semble aussi jouer un rôle inhibiteur sur le protéasome en polyubiquitinant Rpn13 (Ubiquitin Chains Are Remodeled at the Proteasome by Opposing Ubiquitin Ligase and Deubiquitinating Activitie 2006 et The Ubiquitin Ligase Hul5 Promotes Proteasomal Processivity 2009) et Autoubiquitination of the 26S Proteasome on Rpn13 Regulates Breakdown of Ubiquitin Conjugates 2014).
Biologie cellulaire et moléculaireMembrane plasmique
Noyau
Cytoplasme
Réticulum endoplasmique
Appareil de Golgi
Mitochondries
Endosomes
Lysosomes
Peroxysomes
Protéasomes
Cytosquelette
Microfilaments d'actine
Filaments intermédiaires
Microtubules
Matrice extracellulaire
Reproduction
cellulaire
Biochimie
Transport membranaire
Moteurs moléculaires
Voies de signalisation