La base, qui, avec le " couvercle " (lid), compose le complexe régulateur 19S (RP : Regulatory Particle), comprend 10 protéines, et est en contact avec le coeur catalytique 20S - CP : Core Particle - (Base-CP proteasome can serve as a platform for stepwise lid formation 2015).
Le protéasome est une structure dynamique qui modifie sa conformation durant le processus et qui interagit avec un grand nombre de protéines.
L'assemblage du complexe régulateur est favorisé par des protéines chaperons et s'effectue indépendamment pour la base et le " couvercle ".
Les protéines de la base, autres que les Rpt, ainsi que celles du " couvercle " (lid), sont appelées Rpn - Regulatory particle non-ATPase - (Near-atomic resolution structural model of the yeast 26S proteasome 2012).
Rpn1 et Rpn2 , protéines d'échafaudage (scaffold protein), sont relativement similaires (40% d'homologie).
Rpn1 est la plus grande des sous-unités du protéasome.
Rpn1 et Rpn2 contactent l'anneau OB (ou N).
Rpn1 et Rpn2 se lient aussi avec des protéines liées à l'ubiquitine,
Rpn10 et Rpn13 sont des ligands de l'ubiquitine, placés à la périphérie et proches de la région distale, position appropriée pour capturer les substrats (Near-atomic resolution structural model of the yeast 26S proteasome 2012 et Localization of the proteasomal ubiquitin receptors Rpn10 and Rpn13 by electron cryomicroscopy 2012 et Together, Rpn10 and Dsk2 can serve as a polyubiquitin chain-length sensor 2009)
1. Rpn10 contient un (levure) ou deux (Mammifères) domaines UIM, domaine UBD de liaison à l'ubiquitine et un domaine VWA (Von Willebrand factor type A).
Pour certains, Rpn10 ne fait pas partie ni de la base, ni du " couvercle " et se lie uniquement au protéasome 26S lors de son assemblage (Crystal structure of the proteasomal deubiquitylation module Rpn8-Rpn11 2014).
2. Rpn13 :
Biologie cellulaire et moléculaireMembrane plasmiqueNoyauCytoplasmeRéticulum endoplasmiqueAppareil de GolgiMitochondriesEndosomesLysosomesPeroxysomesProtéasomesCytosqueletteMicrofilaments d'actineFilaments intermédiairesMicrotubulesMatrice extracellulaireReproduction cellulaireBiochimieTransport membranaire Moteurs moléculairesVoies de signalisation