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Domaines protéiques à doigt de zinc
Domaine Ring-finger

Sommaire

Le domaine RING (Really Interesting New Gene)-finger est un domaine de structure Cys3HisCys4 qui se lie à deux Zn++.

De nombreuses protéines qui contiennent un domaine RING sont des E3 ubiquitine ligases liées à l'ubiquitination.

Structure

Ce domaine protéique contient de 40 à 60 acides aminés (RING Domain E3 Ubiquitin Ligases 2009).

1. La motif consensus est : Cys-X2-Cys-X9-39-Cys-X1-3-His-X1-3-Cys-X2-Cys-X4-48-Cys-X2-Cys.

Domaine RING
Domaine RING
(Figure : vetopsy.fr)

Cependant, on trouve des variantes, comme dans d'autres domaines contenant des Zn++comme le domaine LIM, où une cystéine ou une histidine est remplacée par un autre résidu, en particulier Asp en 8 dans ROC1/Rbx1 (Structure of the cul1-rbx1-skp1-f boxskp2 scf ubiquitin ligase complex 2000).

2. Le domaine RING adopte une conformation compacte, appelée ββα RING-like fold, comprenant (RINGs hold the key to ubiquitin transfer 2012) :

  • deux brins β (βA et βB),
  • une hélice α,
  • deux boucles qui entourent les ions zinc (boucle ou loop 1 : L1E3, boucle ou loop 2 : L2E3).

Le domaine RING peut être considéré comme un domaine zinc-finger treble clef, entrelacé avec un domaine zinc-ribbon (domaine rubredoxin-like) : il est proche d'autres domaines comme le domaine UBR-box (cf.figure).

Les résidus cystéine et histidine sont enfouis au sein du noyau hydrophobe du domaine.

  • Les liaisons avec les deux Zn++ permettent de stabiliser la structure globale de la protéine comme les motifs à doigt de zinc.
  • Domaine RING et UBR-Box
    Domaine RING et UBR-Box
    (Figure : vetopsy.fr)
    Mais, contrairement aux motifs à doigt de zinc, les deux sites de liaison au zinc sont entrelacés, et forment une surface rigide, plate-forme globulaire pour l'interaction protéine-protéine et appelé pour cela RING (" anneau ").

Les domaines LIM et PHD ont une structure semblable, mais leur repliement est différent et ils ne participent pas à l'ubiquitination.

Rôles

Les domaines RING, comme les U-box, sont des domaines intégrés dans les E3 ubiquitine ligases.

Domaines proches du Domaine RING

Certains domaines, proches des domaines RING, sont :

Bibliographie
  • Lodish et coll - Biologie moléculaire de la cellule - De Boeck Supérieur, Saint-Laurent, 1207 p., 2014
  • Maillet M. - Biologie cellulaire - Abrégés de Masson, 512 p, 2002