• Comportement du chien et
    du chat
  • Celui qui connait vraiment les animaux est par là même capable de comprendre pleinement le caractère unique de l'homme
    • Konrad Lorenz
  • Biologie, neurosciences et
    sciences en général
  •  Le but des sciences n'est pas d'ouvrir une porte à la sagesse infinie,
    mais de poser une limite à l'erreur infinie
    • La vie de Galilée de Bertold Brecht

Domaines protéiques à doigt de zinc
Domaines B-box

Sommaire

Les B-box, dont la structure se rapproche du domaine RING, sont retrouvées dans plus de 1500 protéines.

B-box de type 2 et 1
B-box de type 2 et 1
(Figure : vetopsy.fr)

Structure

Les B-box, divisées en deux groupes (type 1 et 2), sont riches en cystéine et en histidine.

  • Les protéines possèdent soit une simple B-box, en général de type 2 (B2), soit un tandem de B-box de type 1 et 2 (B1B2).
  • Elles peuvent être retrouvées dans des protéines qui ne possèdent pas de domaine RING ou de superhélice (coiled coil).

Leur séquences consensus - le type 2 est plus court de quelques 8 acides aminés - et l'emplacement des résidus qui se lient au zinc est différent.

  • B1 : Cys-X2-Cys-X6-17-Cys-X2-Cys-X4-8-Cys-X2-3-Cys/His-X3-4-His-X5-10-His[Cys5(Cys/His)His2].
  • Liaisons entre B-box de type 2 et 1
    Liaisons entre B-box de type 2 et 1
    (Figure : vetopsy.fr avec l'aimable autorisation de Massiah)
  • B2 : Cys-X2-4-His-X7-10-Cys-X1-4-Asp/Cys4-7-Cys-X2-Cys-X3-6-His-X2-5-His[CysHisCys(Asp/Cys)Cys2His2].

Certains B-box de type 2 ne comporte qu'un seul atome de zinc chélaté par 2 cystéines et deux histidines comme XNF7 du xénope (Enhancement of BRCA1 E3 Ubiquitin Ligase Activity through Direct Interaction with the BARD1 Protein 2002). Une large boucle hydrophobe sans zinc comprend 2 cystéines et un acide aspartique.

Par contre, leurs structures secondaire et tertiaire sont similaires (ββα RING-like fold).

Les B-box sont contenues par exemple dans les domaines TRIM qui comprend aussi un vrai domaine RING-finger N-terminal comme l'Ectodermine/TRIM33.

Rôles

Les B-Box ne peuvent pas recruter l'enzyme de conjugaison E2 (E2 ubiquitin-conjugating enzyme), même si elles sont impliquées dans l'ubiquitination. Le processus engagé est encore inconnu (Structural insights into the TRIM family of ubiquitin E3 ligases 2014).

Bibliographie
  • Lodish et coll - Biologie moléculaire de la cellule - De Boeck Supérieur, Saint-Laurent, 1207 p., 2014
  • Maillet M. - Biologie cellulaire - Abrégés de Masson, 512 p, 2002