• Comportement du chien et
    du chat
  • Celui qui connait vraiment les animaux est par là même capable de comprendre pleinement le caractère unique de l'homme
    • Konrad Lorenz
  • Biologie, neurosciences et
    sciences en général
  •  Le but des sciences n'est pas d'ouvrir une porte à la sagesse infinie,
    mais de poser une limite à l'erreur infinie
    • La vie de Galilée de Bertold Brecht

Modifications post-traductionnelles des protéines
Ubiquitination : mono et polyubiquitination

Sommaire

L'ubiquitination (ou ubiquitinylation) est une modification post-traductionnelle qui aboutit à la fixation covalente d'une protéine d'ubiquitine sur la protéine substrat.

  • Polymérisations de l'ubiquitine
    Polymérisations de l'ubiquitine
    (Figure : vetopsy.fr d'après Komander)
    S'il n'y en a qu'une, on parle de monoubiquitination.
  • S'il y en a plusieurs, on parle de ployubiquitination.

La polyubiquitination peut s'effectuer de deux manières différentes :

  • soit par liaison linéaire canonique entre une extrémité C-terminale de l'une et l'extrémité N-terminale de l'autre,
  • soit par liaisons avec les différentes lysines.

Polyubiquitination par liaison
peptidique canonique linéaire

L'ubiquitine peut se polymériser et former une liaison peptidique canonique linéaire entre :

Polyubiquitination par liaisons
avec les différentes lysines

Liaisons

L'ubiquitination peut se répéter plusieurs fois sur les lysines de l'ubiquitine lié au substrat et peut s'effectuer :

  • en particulier, sur K48 ET K63,
  • mais aussi, sur les autres lysines pour former des chaînes d'ubiquitine.

Ces chaînes peuvent être alors (Atypical ubiquitin chains : new molecular signals 2008) :

  • Polyubiquitinations
    Polyubiquitinations
    (Figure : vetopsy.fr d'après Ikeda)
    des chaînes homologues ou homotypiques (sur la même lysine à chaque fois),
  • des chaînes mixtes par exemple K48/K29 pour former des branches,
  • des chaînes hétérologues entre l'ubiquitine et les UBL-like comme SUMO.

De multiples monoubiquitinations simples peuvent aussi participer à cette polyubiquitination.

Formes du complexe

Cette aptitude de l'ubiquitine à former des polymères est essentielle pour ses différents rôles.

1. La polyubiquitination sur K48 aboutit à la dégradation du substrat.

  • Elle produit des structures compactes.
  • Un sous-groupe de domaines UBA, par exemple dans HR23a (RAD23A) ou MUD1, est pris alors en sandwich entre deux ubiquitines.
  • D'autres peuvent se lier sur chaque ubiquitine comme PLIC-1.

2. La plupart des fonctions non-protéolytiques des chaînes d'ubiquitine sont actuellement associés à des polymères d'ubiquitine liés par K63.

  • Formes des complexes polyubiquitinés
    Formes des complexes polyubiquitinés
    (Figure : vetopsy.fr d'après Ikeda)
    Cette polymérisation produit des chaînes linéaires.
  • Un autre sous-groupe de domaines UBA, par exemple HR23a humaine, se lie classiquement comme à une monoubiquitine.

3. D'autres UBD se fixent indifféremment sur une ou l'autre lysine, comme le domaine UIM (de Rpn10 par exemple).

Rôles de l'ubiquitination