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Enzymes
Groupe des hydrolases (EC3)

Sommaire
définition

Les hydrolases (EC 3) sont une classe d'enzymes, la plus vaste et la plus diversifiée avec plus de 200 enzymes, qui catalysent l'hydrolyse de plusieurs types de composés.

Vue d'ensemble des hydrolases

1. Les hydrolases (EC 3) catalysent l'hydrolyse de plusieurs types de composés selon la réaction :

$\ce{A-B + H2O}$ $\leftrightharpoons$ $\ce{A-OH + BH}$

livre

Vous pouvez lire un article récent : Hydrolases: The Most Diverse Class of Enzymes (2021).

3. Les hydrolases catalysent le clivage hydrolytique des liaisons (Hydrolases: The Most Diverse Class of Enzymes 2021) :

  • carbone-oxygène, i.e. $\ce{-C-O-}$,
  • carbone-azote, i.e. $\ce{-C-N-}$,
  • carbone-carbone, i.e. $\ce{-C-C-}$,
  • phosphore-azote, i.e. $\ce{-P-N-}$…

Les noms systématiques des hydrolases sont " substrat hydrolases ", mais les noms usuels sont généralement sous la forme " substrateases " ou " substratases ", par exemple, estérases, les protéases, les glycosidases et les lipases.

pas bien

Nous ne développerons pas les hydrolases, mais nous donnons les classifications qui peuvent être utiles. Vous pouvez vous reporter aux articles de Wiikipedia pour plus de précisions.

Classification des hydrolases selon le type de liaison

La classification des hydrolases basé sur le type de liaison qu'elles clivent, est représentée dans le tableau suivant.

Sous-classes sous-sous-classe Exemple d'enzyme
3.1 : Liaison ester
(estérases)
3.1.1 : Lipases 3.1.1.3 : Triacylglycérol lipase
3.2 : Glucides 3.2.1 : Glycosidase 3.2.1.1 : α-amylase
3.3 : Liaison éther 3.3.2 : Éther hydrolase 3.3.2.6 : Leukotriéne-A4 hydrolase
3.4 : Liaison peptide
(peptidases)
3.4.21 : Sérine endopeptidase 3.4.21.1 : Chymotrypsine
3.5 : Liaisons C-N
(autres que peptides)
3.5.1 : Amides linéaires 3.5.1.1 : Asparaginase
3.6.1 : Anhydride
d'acide
3.6.1 : Anhydrides contenant P 3.6.1.1 : Diphosphatase ou pyrophosphate
inorganique
3.7 : Liaison C-C 3.7.1 : Dans les cétones 3.7.1.1 : Oxaloacétase
3.8 : Liaison halide 3.8.1 : Liaisons C-X 3.8.1.1 : Alkylhalidase
3.9 : Liaison P-N 3.9.1 : Liaison P-N 3.9.1.1: Phosphoamidase
3.10 : Liaison S-N 3.10.1 : Liaison S-N 3.10.1.1 : N-Sulfoglucosamine sulfohydrolase
3.11 : Liaison C-P 3.11.1 : Liaison C-P 3.11.1.1 : Phosphonoacétaldehyde hydrolase
3.12 : Liaison S-S 3.12.1 : Liaison S-S 3.12.1.1 Trithionate hydrolase
3.13 : Liaison C-S 3.13.1 : Liaison C-S 3.13.1.1 : UDP-Sulfoquinovose synthase
livre

Pour une liste plus précise des hydrolases, reportez-vous à hydrolases de Wikipedia.

Classification des hydrolases selon l'acide aminé

Les hydrolases peuvent être aussi classées selon l'acide aminé qui est impliqué dans l'hydrolyse.

N° Sr Classe Sous-classes
1 A : Carboxyl hydrolases
(aspartyl and glutamyl)
A.01 : Pepsin-like protéases
A.02 : Glycosidases
A.03 : Hydrolases avec un
intermédiaire covalent
aspartyl-substrat
A.04 : Époxide hydrolase-like
2 C : Hydrolases
à cystéine
C.01 : Cys hydrolases avec dyade Cys-His
C.02 : N-terminal cystéine hydrolases
C.03 : Cys hydrolases avec
His comme donneur de proton
C.04 : Tyrosine phosphatase-like
C.05 : Cys hydrolases avec groupe
carboxyl comme accepteur de proton
3
  • H : Hydrolase
    à histidine
H.01 : Ribonucléase-like
H.02 : Hydrolases avec un
intermédiaire covalent
His-substrat
H.03 : Hydrolases de la liaison C-C
4 M: Hydrolases dépendantes
d'un métal
M.01 : Hydrolases dépendante du zinc
M.02 : Hydrolases dépendante du magnésium
M.03 : Hydrolases dépendante du calcium
M.04 : Hydrolases dépendante de
deux métaux (Zn et Mg)
M.05 : Hydrolases dépendante du fer
M.06: Hydrolases dépendante du manganèse
M.X) : Hydrolases sans métal spécifique
5 P : Hydrolases à
proline N-terminal
 
6 S : Hydrolases
à sérine
S.01 : Ser hydrolases avec dyade Ser-His
S.02 : Ser hydrolases avec groupe amine
comme accepteur de proton
(S.03) Ser hydrolases avec groupe carboxyl
comme accepteur de proton
7 T : Hydrolases
à thréonine
T.01 : Asparaginase-like
T.02 : Hydrolases à thréonine N-terminale
8 U : Hydolases
inclassifiables
U.01 : Protéines sans activité hydrolase
U.02 : Hydrolases sans domaine catalytique connu
9 Y : Hydrolases
à tyrosine
Y.01 : Sialidases
10 Z : Hydrolases
assistées par un substrate-
ou ocfactor-dependant es
Z.01 : Phosphatases avec un substrat phosphate
comme base catalytique
Z.02 : désacétylases NAD(+)-dependant es
Z.03 : Hydrolases avec étapes
oxydation/réduction